DNA序列(DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006, UVa1368) rust解法

2023-10-14 21:20

本文主要是介绍DNA序列(DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006, UVa1368) rust解法,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

输入m个长度均为n的DNA序列,求一个DNA序列,到所有序列的总Hamming距离尽量小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数,例如,ACGT和GCGA的Hamming距离为2(左数第1, 4个字符不同)。
输入整数m和n(4≤m≤50,4≤n≤1000),以及m个长度为n的DNA序列(只包含字母A,C,G,T),输出到m个序列的Hamming距离和最小的DNA序列和对应的距离。如有多解,要求为字典序最小的解。例如,对于下面5个DNA序列,最优解为TAAGATAC。
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT

解法

use std::{collections::HashMap, io};fn main() {let mut grid: Vec<Vec<char>> = vec![];let mut buf = String::new();io::stdin().read_line(&mut buf).unwrap();let mut iter = buf.split_whitespace();let m: usize = iter.next().unwrap().parse().unwrap();let n: usize = iter.next().unwrap().parse().unwrap();for _i in 0..m {let mut buf = String::new();io::stdin().read_line(&mut buf).unwrap();let cs = buf.trim().chars().collect();grid.push(cs);}/*for s in &grid {let s: String = s.iter().collect();println!("{:?}", s);}*/let mut ans = String::new();for i in 0..n {let mut kv = HashMap::new();for j in 0..m {kv.entry(grid[j][i]).and_modify(|num| *num += 1).or_insert(1);}let mut mc = (' ', 0);let mut cs: Vec<_> = kv.keys().collect();cs.sort();for k in cs {if kv.get(k).unwrap() > &mc.1 {mc = (*k, *kv.get(k).unwrap());}}ans.push(mc.0);}println!("{}", ans);
}

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