代谢ADMET在线网页预测工具SwissADME 、SOMP 、BioTransformer

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药物代谢(Drug Metabolism)指药物在体内多种药物代谢酶(尤其肝药酶)的作用下,化学结构发生改变的过程;包括分解代谢和合成代谢

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1、概念

药物的代谢反应大致可以分为氧化(oxidation)、还原(reduction)、水解(hydrolysis)和结合(conjugation)四种类型。
又可划分为两个阶段,Ⅰ相代谢可为氧化、还原和水解反应,Ⅱ相代谢为结合反应。有些药物可以同时通过几种不同类型的反应进行代谢。

肝脏是药物的主要代谢器官,富含Ⅰ相代谢和Ⅱ相代谢所需的各种酶。催化Ⅰ相代谢的主要是肝微粒体中的CYP450酶,催化Ⅱ相代谢的主要是尿苷二磷酸葡醛酸转移酶(UGTS)、N-乙酰基转移酶(NATs)、甲基转移酶(MTs)、谷胱甘肽转移酶(GSTs)、硫酸转移酶(SULTs)等。除肝脏外,有些药物还存在肝外代谢,如肠道、血液、肾、肺、脑等。

其中以细胞色素酶P450代谢酶系最为重要。P450酶是由多种类型的P450酶所组成的一个大家族,有许多同工酶和亚型组成,命名时用CPY代表CYP450,其后加阿拉伯数字表示CPY450的家族成员,例如CYP1、CPY2、CPY3等,在数字后加字母,则代表亚家族,如CYP1A、CYP2C、CYP2D、CYP2E等
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2、在线网页预测工具SwissADME 、SOMP 、BioTransformer

药物代谢的软件预测一般包含基于规则的方法、机器学习、数据挖掘、量子化学方法、分子相互作用领域和对接等

按预测的方向又大概划分为CYP特异性的预测、代谢部位的预测和代谢产物的预测
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1)SwissADME

SwissADME(http://www.swissadme.ch)网络在线工具快速提供药物分子的物理化学特性,药代动力学,药物相似性和药物化学友好性等的快速预测,并支持下载

2)SOMP

SOMP(http://www.way2drug.com/somp)是一个用于代谢位点(SOM)计算机预测的 Web 服务,(五种主要人类)类药物代谢部位的预测并支持下载

3)BioTransformer

BioTransformer (https://biotransformer.ca)网络在线工具快速提供代谢物预测和化合物识别,基于机器学习与知识的方法相结合,包括Ⅰ相、Ⅱ相的代谢预测,并支持下载和离线jave包运行

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