代谢ADMET在线网页预测工具SwissADME 、SOMP 、BioTransformer

本文主要是介绍代谢ADMET在线网页预测工具SwissADME 、SOMP 、BioTransformer,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

药物代谢(Drug Metabolism)指药物在体内多种药物代谢酶(尤其肝药酶)的作用下,化学结构发生改变的过程;包括分解代谢和合成代谢

在这里插入图片描述

1、概念

药物的代谢反应大致可以分为氧化(oxidation)、还原(reduction)、水解(hydrolysis)和结合(conjugation)四种类型。
又可划分为两个阶段,Ⅰ相代谢可为氧化、还原和水解反应,Ⅱ相代谢为结合反应。有些药物可以同时通过几种不同类型的反应进行代谢。

肝脏是药物的主要代谢器官,富含Ⅰ相代谢和Ⅱ相代谢所需的各种酶。催化Ⅰ相代谢的主要是肝微粒体中的CYP450酶,催化Ⅱ相代谢的主要是尿苷二磷酸葡醛酸转移酶(UGTS)、N-乙酰基转移酶(NATs)、甲基转移酶(MTs)、谷胱甘肽转移酶(GSTs)、硫酸转移酶(SULTs)等。除肝脏外,有些药物还存在肝外代谢,如肠道、血液、肾、肺、脑等。

其中以细胞色素酶P450代谢酶系最为重要。P450酶是由多种类型的P450酶所组成的一个大家族,有许多同工酶和亚型组成,命名时用CPY代表CYP450,其后加阿拉伯数字表示CPY450的家族成员,例如CYP1、CPY2、CPY3等,在数字后加字母,则代表亚家族,如CYP1A、CYP2C、CYP2D、CYP2E等
在这里插入图片描述

2、在线网页预测工具SwissADME 、SOMP 、BioTransformer

药物代谢的软件预测一般包含基于规则的方法、机器学习、数据挖掘、量子化学方法、分子相互作用领域和对接等

按预测的方向又大概划分为CYP特异性的预测、代谢部位的预测和代谢产物的预测
在这里插入图片描述

1)SwissADME

SwissADME(http://www.swissadme.ch)网络在线工具快速提供药物分子的物理化学特性,药代动力学,药物相似性和药物化学友好性等的快速预测,并支持下载

2)SOMP

SOMP(http://www.way2drug.com/somp)是一个用于代谢位点(SOM)计算机预测的 Web 服务,(五种主要人类)类药物代谢部位的预测并支持下载

3)BioTransformer

BioTransformer (https://biotransformer.ca)网络在线工具快速提供代谢物预测和化合物识别,基于机器学习与知识的方法相结合,包括Ⅰ相、Ⅱ相的代谢预测,并支持下载和离线jave包运行

这篇关于代谢ADMET在线网页预测工具SwissADME 、SOMP 、BioTransformer的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/179255

相关文章

Java数字转换工具类NumberUtil的使用

《Java数字转换工具类NumberUtil的使用》NumberUtil是一个功能强大的Java工具类,用于处理数字的各种操作,包括数值运算、格式化、随机数生成和数值判断,下面就来介绍一下Number... 目录一、NumberUtil类概述二、主要功能介绍1. 数值运算2. 格式化3. 数值判断4. 随机

使用Navicat工具比对两个数据库所有表结构的差异案例详解

《使用Navicat工具比对两个数据库所有表结构的差异案例详解》:本文主要介绍如何使用Navicat工具对比两个数据库test_old和test_new,并生成相应的DDLSQL语句,以便将te... 目录概要案例一、如图两个数据库test_old和test_new进行比较:二、开始比较总结概要公司存在多

Java中基于注解的代码生成工具MapStruct映射使用详解

《Java中基于注解的代码生成工具MapStruct映射使用详解》MapStruct作为一个基于注解的代码生成工具,为我们提供了一种更加优雅、高效的解决方案,本文主要为大家介绍了它的具体使用,感兴趣... 目录介绍优缺点优点缺点核心注解及详细使用语法说明@Mapper@Mapping@Mappings@Co

使用Python实现图片和base64转换工具

《使用Python实现图片和base64转换工具》这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用Python中的base64模块编写一个工具,可以实现图片和Base64编码之间的转换,感兴趣的小伙伴可以了解下... 简介使用python的base64模块来实现图片和Base64编码之间的转换。可以将图片转换为Bas

使用Java实现一个解析CURL脚本小工具

《使用Java实现一个解析CURL脚本小工具》文章介绍了如何使用Java实现一个解析CURL脚本的工具,该工具可以将CURL脚本中的Header解析为KVMap结构,获取URL路径、请求类型,解析UR... 目录使用示例实现原理具体实现CurlParserUtilCurlEntityICurlHandler

Rsnapshot怎么用? 基于Rsync的强大Linux备份工具使用指南

《Rsnapshot怎么用?基于Rsync的强大Linux备份工具使用指南》Rsnapshot不仅可以备份本地文件,还能通过SSH备份远程文件,接下来详细介绍如何安装、配置和使用Rsnaps... Rsnapshot 是一款开源的文件系统快照工具。它结合了 Rsync 和 SSH 的能力,可以帮助你在 li

基于Go语言实现一个压测工具

《基于Go语言实现一个压测工具》这篇文章主要为大家详细介绍了基于Go语言实现一个简单的压测工具,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录整体架构通用数据处理模块Http请求响应数据处理Curl参数解析处理客户端模块Http客户端处理Grpc客户端处理Websocket客户端

java图像识别工具类(ImageRecognitionUtils)使用实例详解

《java图像识别工具类(ImageRecognitionUtils)使用实例详解》:本文主要介绍如何在Java中使用OpenCV进行图像识别,包括图像加载、预处理、分类、人脸检测和特征提取等步骤... 目录前言1. 图像识别的背景与作用2. 设计目标3. 项目依赖4. 设计与实现 ImageRecogni

基于Python开发电脑定时关机工具

《基于Python开发电脑定时关机工具》这篇文章主要为大家详细介绍了如何基于Python开发一个电脑定时关机工具,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录1. 简介2. 运行效果3. 相关源码1. 简介这个程序就像一个“忠实的管家”,帮你按时关掉电脑,而且全程不需要你多做

基于C#实现PDF文件合并工具

《基于C#实现PDF文件合并工具》这篇文章主要为大家详细介绍了如何基于C#实现一个简单的PDF文件合并工具,文中的示例代码简洁易懂,有需要的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 界面主要用于发票PDF文件的合并。经常出差要报销的很有用。代码using System;using System.Col