WHU服务器下载SRA数据库方案

2024-09-07 12:48

本文主要是介绍WHU服务器下载SRA数据库方案,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

文章目录

  • 一、你需要什么
  • 二、你要怎么做
    • 1. 准备下载索引
    • 2. wget -i list.txt
  • 注意


提示:这里可以添加本文要记录的大概内容:
例如:随着人工智能的不断发展,机器学习这门技术也越来越重要,很多人都开启了学习机器学习,本文就介绍了机器学习的基础内容。


提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考

一、你需要什么

177 地址下工作,一个明确的SRA。

二、你要怎么做

1. 准备下载索引

比如SRP266461(示例):
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRP266461

在这里插入图片描述
Send to —— File —— RunInfo
在这里插入图片描述
得到一个 SraRunInfo.csv, 其中就包含download.path

在这里插入图片描述
提出来,做一个TXT

$ cat list.txt 
download_path
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953231/SRR11953231.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953232/SRR11953232.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953233/SRR11953233.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953234/SRR11953234.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953235/SRR11953235.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953236/SRR11953236.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953237/SRR11953237.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953242/SRR11953242.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953243/SRR11953243.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953244/SRR11953244.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953245/SRR11953245.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953246/SRR11953246.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953247/SRR11953247.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953248/SRR11953248.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953249/SRR11953249.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953250/SRR11953250.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953251/SRR11953251.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953252/SRR11953252.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953253/SRR11953253.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953254/SRR11953254.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953255/SRR11953255.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953256/SRR11953256.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953257/SRR11953257.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953258/SRR11953258.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953259/SRR11953259.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953260/SRR11953260.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953261/SRR11953261.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953262/SRR11953262.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953263/SRR11953263.1
https://sra-downloadb.be

这篇关于WHU服务器下载SRA数据库方案的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1145100

相关文章

Go语言开发实现查询IP信息的MCP服务器

《Go语言开发实现查询IP信息的MCP服务器》随着MCP的快速普及和广泛应用,MCP服务器也层出不穷,本文将详细介绍如何在Go语言中使用go-mcp库来开发一个查询IP信息的MCP... 目录前言mcp-ip-geo 服务器目录结构说明查询 IP 信息功能实现工具实现工具管理查询单个 IP 信息工具的实现服

Java Response返回值的最佳处理方案

《JavaResponse返回值的最佳处理方案》在开发Web应用程序时,我们经常需要通过HTTP请求从服务器获取响应数据,这些数据可以是JSON、XML、甚至是文件,本篇文章将详细解析Java中处理... 目录摘要概述核心问题:关键技术点:源码解析示例 1:使用HttpURLConnection获取Resp

Java实现优雅日期处理的方案详解

《Java实现优雅日期处理的方案详解》在我们的日常工作中,需要经常处理各种格式,各种类似的的日期或者时间,下面我们就来看看如何使用java处理这样的日期问题吧,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录前言一、日期的坑1.1 日期格式化陷阱1.2 时区转换二、优雅方案的进阶之路2.1 线程安全重构2

springboot上传zip包并解压至服务器nginx目录方式

《springboot上传zip包并解压至服务器nginx目录方式》:本文主要介绍springboot上传zip包并解压至服务器nginx目录方式,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有错误... 目录springboot上传zip包并解压至服务器nginx目录1.首先需要引入zip相关jar包2.然

将Java项目提交到云服务器的流程步骤

《将Java项目提交到云服务器的流程步骤》所谓将项目提交到云服务器即将你的项目打成一个jar包然后提交到云服务器即可,因此我们需要准备服务器环境为:Linux+JDK+MariDB(MySQL)+Gi... 目录1. 安装 jdk1.1 查看 jdk 版本1.2 下载 jdk2. 安装 mariadb(my

数据库面试必备之MySQL中的乐观锁与悲观锁

《数据库面试必备之MySQL中的乐观锁与悲观锁》:本文主要介绍数据库面试必备之MySQL中乐观锁与悲观锁的相关资料,乐观锁适用于读多写少的场景,通过版本号检查避免冲突,而悲观锁适用于写多读少且对数... 目录一、引言二、乐观锁(一)原理(二)应用场景(三)示例代码三、悲观锁(一)原理(二)应用场景(三)示例

Node.js 数据库 CRUD 项目示例详解(完美解决方案)

《Node.js数据库CRUD项目示例详解(完美解决方案)》:本文主要介绍Node.js数据库CRUD项目示例详解(完美解决方案),本文给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考... 目录项目结构1. 初始化项目2. 配置数据库连接 (config/db.js)3. 创建模型 (models/

前端下载文件时如何后端返回的文件流一些常见方法

《前端下载文件时如何后端返回的文件流一些常见方法》:本文主要介绍前端下载文件时如何后端返回的文件流一些常见方法,包括使用Blob和URL.createObjectURL创建下载链接,以及处理带有C... 目录1. 使用 Blob 和 URL.createObjectURL 创建下载链接例子:使用 Blob

Spring Security基于数据库的ABAC属性权限模型实战开发教程

《SpringSecurity基于数据库的ABAC属性权限模型实战开发教程》:本文主要介绍SpringSecurity基于数据库的ABAC属性权限模型实战开发教程,本文给大家介绍的非常详细,对大... 目录1. 前言2. 权限决策依据RBACABAC综合对比3. 数据库表结构说明4. 实战开始5. MyBA

Java图片压缩三种高效压缩方案详细解析

《Java图片压缩三种高效压缩方案详细解析》图片压缩通常涉及减少图片的尺寸缩放、调整图片的质量(针对JPEG、PNG等)、使用特定的算法来减少图片的数据量等,:本文主要介绍Java图片压缩三种高效... 目录一、基于OpenCV的智能尺寸压缩技术亮点:适用场景:二、JPEG质量参数压缩关键技术:压缩效果对比