WHU服务器下载SRA数据库方案

2024-09-07 12:48

本文主要是介绍WHU服务器下载SRA数据库方案,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

文章目录

  • 一、你需要什么
  • 二、你要怎么做
    • 1. 准备下载索引
    • 2. wget -i list.txt
  • 注意


提示:这里可以添加本文要记录的大概内容:
例如:随着人工智能的不断发展,机器学习这门技术也越来越重要,很多人都开启了学习机器学习,本文就介绍了机器学习的基础内容。


提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考

一、你需要什么

177 地址下工作,一个明确的SRA。

二、你要怎么做

1. 准备下载索引

比如SRP266461(示例):
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRP266461

在这里插入图片描述
Send to —— File —— RunInfo
在这里插入图片描述
得到一个 SraRunInfo.csv, 其中就包含download.path

在这里插入图片描述
提出来,做一个TXT

$ cat list.txt 
download_path
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953231/SRR11953231.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953232/SRR11953232.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953233/SRR11953233.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953234/SRR11953234.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953235/SRR11953235.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953236/SRR11953236.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953237/SRR11953237.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953242/SRR11953242.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953243/SRR11953243.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953244/SRR11953244.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953245/SRR11953245.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953246/SRR11953246.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953247/SRR11953247.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953248/SRR11953248.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953249/SRR11953249.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953250/SRR11953250.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953251/SRR11953251.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953252/SRR11953252.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953253/SRR11953253.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953254/SRR11953254.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953255/SRR11953255.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953256/SRR11953256.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953257/SRR11953257.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953258/SRR11953258.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953259/SRR11953259.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-20/SRR11953260/SRR11953260.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-21/SRR11953261/SRR11953261.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953262/SRR11953262.1
https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos3/sra-pub-run-19/SRR11953263/SRR11953263.1
https://sra-downloadb.be

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http://www.chinasem.cn/article/1145100

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