生信软件34 - 大幅提升Python程序执行效率的工具Pypy

2024-09-07 01:36

本文主要是介绍生信软件34 - 大幅提升Python程序执行效率的工具Pypy,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在生信开发过程中,会大量使用Python脚本,除了多进程和多线程编程提高程序运行效率外,还可以借助效率更高的Python解释器来提高程序的运行速度, CPython 使用c语言实现的解释器PyPy 使用python语言的子集RPython实现的解释器,一般情况下PyPy比CPython快4倍左右

1. 比较解释器的运行效率

# task.py
import timedef compute_task():"""计算平方和"""total = 0for i in range(1, 10000000):total += i ** 2return totaldef time_execution(func):start_time = time.time()func()end_time = time.time()return end_time - start_timeif __name__ == "__main__":execution_time = time_execution(compute_task)print(f"Execution time: {execution_time:.4f} seconds")

2种不同解释器运行程序消耗时间:

使用pypy3运行相同程序,运行消耗时间约为CPython消耗时间的1/16。

python task.py
# Execution time: 2.5991 secondspyp3 task.py
# Execution time: 0.1562 seconds

2. conda 安装pypy

conda-forge通道支持使用PyPy解释器创建和安装包到环境中, conda安装目前仅支持的Python版本是3.8和3.9

# 创建环境
conda create -c conda-forge -n pypy3.9 pypy python=3.9# 激活环境
conda activate pypy3.9# 使用严格的通道优先级
conda config --set channel_priority strict

3. pypy下载安装

# linux 64 python3.10版本下载
wget https://downloads.python.org/pypy/pypy3.10-v7.3.17-linux64.tar.bz2
tar -xvjf pypy3.10-v7.3.17-linux64.tar.bz2# linux 64 python3.9版本下载
wget https://downloads.python.org/pypy/pypy3.9-v7.3.10-linux64.tar.bz2
tar -xvjf pypy3.9-v7.3.10-linux64.tar.bz2

windows版本:

python3.10 : https://downloads.python.org/pypy/pypy3.10-v7.3.17-win64.zip
python3.9 : https://downloads.python.org/pypy/pypy3.9-v7.3.16-win64.zip

3.1 基于python 3.10和python 2.7的pypy安装

下载地址: https://pypy.org/download.html

在这里插入图片描述

3.2 python 其他版本安装pypy

下载地址: https://downloads.python.org/pypy/

linux64和win64下载截图

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这篇关于生信软件34 - 大幅提升Python程序执行效率的工具Pypy的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



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