两个基因相关性细胞系(CCLE)(升级)

2024-06-24 00:52

本文主要是介绍两个基因相关性细胞系(CCLE)(升级),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

目录

单基因CCLE数据

①细胞系转录组CCLE数据下载

②单基因泛癌表达

CCLE两个基因相关性

①进行数据整理

②相关性分析

单基因CCLE数据
①细胞系转录组CCLE数据下载

基因在各个细胞系表达情况_ccle expression 23q4-CSDN博客

rm(list = ls())
library(tidyverse)
library(ggpubr)
rt <- data.table::fread("GAPDH Expression Public 24Q2.csv",data.table = F)
head(rt)

 数据格式

②单基因泛癌表达
##泛癌绘制##
p1 <- ggplot(rt,aes(x=reorder(`Primary Disease`,&#

这篇关于两个基因相关性细胞系(CCLE)(升级)的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1088746

相关文章

剑指offer(C++)--和为S的两个数字

题目 输入一个递增排序的数组和一个数字S,在数组中查找两个数,使得他们的和正好是S,如果有多对数字的和等于S,输出两个数的乘积最小的。 class Solution {public:vector<int> FindNumbersWithSum(vector<int> array,int sum) {vector<int> result;int len = array.size();if(

剑指offer(C++)--两个链表的第一个公共结点

题目 输入两个链表,找出它们的第一个公共结点。 解法一 两个链表一定有交点的话,方法是指向短链表指针先走完,然后指向长链表,指向长链表指针后走完,指向短链表。所以,第二次走过,一定会在交点相遇。 class Solution {public:ListNode* FindFirstCommonNode( ListNode *pHead1, ListNode *pHead2) {ListN

两个基因相关性CPTAC蛋白组数据

目录 蛋白数据下载 ①蛋白数据下载 1,TCGA-选择泛癌数据  2,TCGA-TCPA 3,CPTAC(非TCGA) ②蛋白相关性分析 1,数据整理 2,蛋白相关性分析 PCAS在线分析 蛋白数据下载 CPTAC蛋白组学数据库介绍及数据下载分析 – 王进的个人网站 (jingege.wang) ①蛋白数据下载 可以下载泛癌蛋白数据:UCSC Xena (xena

【文末附gpt升级秘笈】腾讯元宝AI搜索解析能力升级:千万字超长文处理的新里程碑

腾讯元宝AI搜索解析能力升级:千万字超长文处理的新里程碑 一、引言 随着人工智能技术的飞速发展,自然语言处理(NLP)和机器学习(ML)在各行各业的应用日益广泛。其中,AI搜索解析能力作为信息检索和知识抽取的核心技术,受到了广泛的关注和研究。腾讯作为互联网行业的领军企业,其在AI领域的探索和创新一直走在前列。近日,腾讯旗下的AI大模型应用——腾讯元宝,迎来了1.1.7版本的升级,新版本在AI搜

剑指offer—编程题7(用两个栈实现一个队列)

题目:用两个栈实现一个队列。队列的声明如下,请实现它的两个函数appendTail 和deleteHead,分别完成在队列尾部插入结点和在队列头部删除结点的功能。 代码如下: [java]  view plain copy print ? public class Test07 {       /**       * 用两个栈模拟的队列       *

算法9—两个巨大正整数相加

两个巨大整数相加,可能会造成溢出,或者它的大小已经超出基本数据类型的范围,所以,我们对巨大整数进行相加时,可以把它们转换成字符串,然后通过字符串的处理进行整数相加。 这里有两种做法:第一种,把整数存在一个字符数组里进行处理。代码如下: [java]  view plain copy public static String addThroughArray(String

算法8—不通过比较,找出两个数的最大值

问题: 比如:给定两个值 5和10,不通过比较,直接找出最大值。 分析: 一旦涉及到不用比较找最大值,想都不用想,一般只能通过位运算来实现。  max = a - ((a-b)&((a-b)>>31)) 或者 max = ((a+b)+|a-b|)/2 如果找最小值,我们只需把两个值相加,减去max即可。

算法6— 判断两个链表是否相交

问题: 给出两个单向链表的头指针,比如h1、h2,判断链表是否相交,如果不相交返回NULL;如果相交,返回指向第一个相交节点的指针。时间复杂度控制在O(n)。 分析: 如果两单向链表相交的话,一定是Y型相交,不可能出现X型,弄清楚这点后接下来的工作就是: (1)先找到h1,h2的最后一个节点L1和L2,同时记录节点数量a,b;(这里假设 a > b) (2)判断最后一个节点是否相同

SpringBoot中如何监听两个不同源的RabbitMQ消息队列

spring-boot如何配置监听两个不同的RabbitMQ 由于前段时间在公司开发过程中碰到了一个问题,需要同时监听两个不同的rabbitMq,但是之前没有同时监听两个RabbitMq的情况,因此在同事的帮助下,成功实现了监听多个MQ。下面我给大家一步一步讲解下,也为自己做个笔记; 详细步骤: 1. application.properties 文件配置: u.rabbitmq.ad

java同步锁以及级别升级的理解

首先简单说下先偏向锁、轻量级锁、重量级锁三者各自的应用场景: 偏向锁:只有一个线程进入临界区;轻量级锁:多个线程交替进入临界区;重量级锁:多个线程同时进入临界区。 还要明确的是,偏向锁、轻量级锁都是JVM引入的锁优化手段,目的是降低线程同步的开销。比如以下的同步代码块:   synchronized (lockObject) { // do something } 上述同步代码块