biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置

2024-06-23 21:18

本文主要是介绍biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

就目前来看,这一周主要以补交上次作业为主,所以上一周的总结增加了很多新内容。但是关于本体论和富集分析,大家还是有点小困难。当然我自己交东西也慢了很多,因为时间也总是不太够,完全靠周末挤出来。

第三周笔记汇总如下

  • Biostar学习笔记(3)Gene set analysis related topics.
  • 本体论
  • biostarhandboo(四)|本体论和功能分析
  • 基因本体论

第四周作业发布

我们处在大数据时代,尤其是测序技术诞生之后,测序仪生产的数据更是不可思议地多。那么问题来了,我们每个人都在说数据,但是数据(data)是什么呢?还有一个问题数据格式(data format)又是什么?数据那么多,你需要的数据存放在哪里,你需要到哪里才能找到这些数据呢?这些都是你这一周需要思考的问题。

第四周的任务是阅读第六章和第七章的内容。这部分内容比较简单,都是属于了解即可的内容。此外,这一周涉及到命令行操作的代码也有很多,可能需要一段时间去练习。

  • 了解GenBank格式
  • 了解FASTA/FASTQ格式,尤其是FASTA的命名方式
  • 整理目前你已知的数据库
  • 学会使用命令行访问NCBI
  • 学会从数据库下载数据到本地,以SRA为例。

这篇关于biostar handbook: 第三周笔记汇总+第四周任务布置的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1088297

相关文章

Oracle数据库使用 listagg去重删除重复数据的方法汇总

《Oracle数据库使用listagg去重删除重复数据的方法汇总》文章介绍了在Oracle数据库中使用LISTAGG和XMLAGG函数进行字符串聚合并去重的方法,包括去重聚合、使用XML解析和CLO... 目录案例表第一种:使用wm_concat() + distinct去重聚合第二种:使用listagg,

Python Invoke自动化任务库的使用

《PythonInvoke自动化任务库的使用》Invoke是一个强大的Python库,用于编写自动化脚本,本文就来介绍一下PythonInvoke自动化任务库的使用,具有一定的参考价值,感兴趣的可以... 目录什么是 Invoke?如何安装 Invoke?Invoke 基础1. 运行测试2. 构建文档3.

解决Cron定时任务中Pytest脚本无法发送邮件的问题

《解决Cron定时任务中Pytest脚本无法发送邮件的问题》文章探讨解决在Cron定时任务中运行Pytest脚本时邮件发送失败的问题,先优化环境变量,再检查Pytest邮件配置,接着配置文件确保SMT... 目录引言1. 环境变量优化:确保Cron任务可以正确执行解决方案:1.1. 创建一个脚本1.2. 修

Java实现任务管理器性能网络监控数据的方法详解

《Java实现任务管理器性能网络监控数据的方法详解》在现代操作系统中,任务管理器是一个非常重要的工具,用于监控和管理计算机的运行状态,包括CPU使用率、内存占用等,对于开发者和系统管理员来说,了解这些... 目录引言一、背景知识二、准备工作1. Maven依赖2. Gradle依赖三、代码实现四、代码详解五

如何使用celery进行异步处理和定时任务(django)

《如何使用celery进行异步处理和定时任务(django)》文章介绍了Celery的基本概念、安装方法、如何使用Celery进行异步任务处理以及如何设置定时任务,通过Celery,可以在Web应用中... 目录一、celery的作用二、安装celery三、使用celery 异步执行任务四、使用celery

Java 枚举的常用技巧汇总

《Java枚举的常用技巧汇总》在Java中,枚举类型是一种特殊的数据类型,允许定义一组固定的常量,默认情况下,toString方法返回枚举常量的名称,本文提供了一个完整的代码示例,展示了如何在Jav... 目录一、枚举的基本概念1. 什么是枚举?2. 基本枚举示例3. 枚举的优势二、枚举的高级用法1. 枚举

什么是cron? Linux系统下Cron定时任务使用指南

《什么是cron?Linux系统下Cron定时任务使用指南》在日常的Linux系统管理和维护中,定时执行任务是非常常见的需求,你可能需要每天执行备份任务、清理系统日志或运行特定的脚本,而不想每天... 在管理 linux 服务器的过程中,总有一些任务需要我们定期或重复执行。就比如备份任务,通常会选在服务器资

【学习笔记】 陈强-机器学习-Python-Ch15 人工神经网络(1)sklearn

系列文章目录 监督学习:参数方法 【学习笔记】 陈强-机器学习-Python-Ch4 线性回归 【学习笔记】 陈强-机器学习-Python-Ch5 逻辑回归 【课后题练习】 陈强-机器学习-Python-Ch5 逻辑回归(SAheart.csv) 【学习笔记】 陈强-机器学习-Python-Ch6 多项逻辑回归 【学习笔记 及 课后题练习】 陈强-机器学习-Python-Ch7 判别分析 【学

系统架构师考试学习笔记第三篇——架构设计高级知识(20)通信系统架构设计理论与实践

本章知识考点:         第20课时主要学习通信系统架构设计的理论和工作中的实践。根据新版考试大纲,本课时知识点会涉及案例分析题(25分),而在历年考试中,案例题对该部分内容的考查并不多,虽在综合知识选择题目中经常考查,但分值也不高。本课时内容侧重于对知识点的记忆和理解,按照以往的出题规律,通信系统架构设计基础知识点多来源于教材内的基础网络设备、网络架构和教材外最新时事热点技术。本课时知识

论文阅读笔记: Segment Anything

文章目录 Segment Anything摘要引言任务模型数据引擎数据集负责任的人工智能 Segment Anything Model图像编码器提示编码器mask解码器解决歧义损失和训练 Segment Anything 论文地址: https://arxiv.org/abs/2304.02643 代码地址:https://github.com/facebookresear