「Debug R」一个Seurat导致的Rstudio网页版经常被终止的bug

2024-06-23 19:58

本文主要是介绍「Debug R」一个Seurat导致的Rstudio网页版经常被终止的bug,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

在网页版的Rstuio加载Seurat时,等待了很久都没有成功,刷新网页后就出现了如下的提示

 

报错信息

测试了其他包,例如ggplot2,都没有任何问题,唯独是Seurat出现了问题,因此我用关键词"seurat cause rsession terminated" 进行搜索,发现有人在Rstudio的社区上提出了这个问题,看来我并不是一个人遇到这个问题。

我尝试里帖子https://community.rstudio.com/t/r-studio-crashes-when-loading-seurat-package/57931的解决方法,也就是卸载reticulate, 卸载Seurat,然后重装Seurat,但是对我而言没有什么效果。

remove.packages('reticulate')
remove.packages('Seurat')
install.packages('Seurat')
library(Seurat)

我测试了重启Rstudio服务器,发现这也没有什么效果。甚至将我的Rstudio-server升级到最新版本,也没有解决这个问题。

令人吃惊的是,这个问题只在我的用户中存在,其他用户并没有这个报错。

因此,目前我想到了下面几种解决方法:

  1. 使用jupyter notebook
  2. 新建一个用户
  3. 等待Rstudio-serve更新的版本解决这个问题

难受。。。

这篇关于「Debug R」一个Seurat导致的Rstudio网页版经常被终止的bug的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1088127

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