利用梯度提升树分类法实现乳腺癌数据集分类

2024-06-07 21:44

本文主要是介绍利用梯度提升树分类法实现乳腺癌数据集分类,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

目录

  • 1. 作者介绍
  • 2. 梯度提升树算法
    • 2.1 Boosting 算法
    • 2.2 Boosting Tree (提升树)
    • 2.3 梯度提升树(Gradient Boosting Tree)
  • 3. 利用梯度提升树分类法实现乳腺癌数据集分类实验
    • 3.1 乳腺癌数据集介绍
    • 3.2 实验过程
    • 3.3 实验结果
    • 3.4 完整代码
  • 4. 参考文献

1. 作者介绍

谈翠红,女,西安工程大学电子信息学院,2023级研究生
研究方向:机器视觉与人工智能
电子邮件:t19856597379@163.com

徐达,男,西安工程大学电子信息学院,2023级研究生,张宏伟人工智能课题组
研究方向:机器视觉与人工智能
电子邮件:1374455905@qq.com

2. 梯度提升树算法

2.1 Boosting 算法

在这里插入图片描述
从图可以看出,Boosting 算法的工作机制是从训练集用初始权重训练出一个弱学习器1,根据弱学习器的学习误差率来更新训练样本的权重,使得之前弱学习器1中学习误差率高的训练样本点权重变高。然后这些误差率高的点在弱学习器2中得到更高的重视,利用调整权重后的训练集来训练弱学习器2。如此重复进行,直到弱学习器数达到事先指定的数目T,最终将这T个弱学习器通过集合策略进行整合,得到最终的强学习器。了解Boosting方法后,我们便可将Boosting方法和Decision Tree相结合便可得到Boosting Decision Tree。

2.2 Boosting Tree (提升树)

提升树是以决策树为基本学习器的提升方法,它被认为是统计学习中性能最好的方法之一。对于分类问题,提升树的决策树是二叉决策树,对于回归问题,提升树中的决策是二叉回归树。不同问题的提升树学习算法主要区别在于使用的损失函数不同。
提升树模型可以表示为决策树为基学习器的加法模型:
在这里插入图片描述
其中,hm(x ;θm)表示第m个决策树,θm为第 m个决策树的参数,M为决策树的数量。
在这里插入图片描述
从图能够直观的看到,提升树的学习思想有点类似打高尔夫球,先粗略的打一杆,然后在之前的基础上逐步靠近球洞,也就是说每一棵树学习的是之前所有树的结论和残差,这个残差就是一个加预测值后得到真实值的累加量。

2.3 梯度提升树(Gradient Boosting Tree)

基于前面介绍的提升树基本思路,可以发现这个算法没有解决损失函数拟合方法的问题。针对这个问题,Freidman提出用损失函数的负梯度来拟合损失的近似值,所以结合得到了梯度提升树算法。而本次实验所使用的是梯度提升树分类算法,它是通过逐步构建一系列的决策树,每棵树都拟合前一棵树的残差,从而逐步提高模型的预测性能。通过对乳腺癌数据集的分类,梯度提升树能够有效地区分良性和恶性肿瘤,同时提供每个特征的重要性,从而帮助理解哪些特征对预测结果影响最大。它的核心原理如下:
初始化一个弱学习器F0(x) ,通常使用一个简单的初始模型(如平均值)来拟合目标变量y 。
对于m=1, 2, . . . , M (M 为迭代次数),迭代进行以下步骤:
计算当前模型的残差rim = yi-F(m-1)(xi) ,其中 F(m-1)(xi) 是前 m-1 个模型的组合预测结果。
拟合一个新的基本学习器 hm(x) ,使得 hm(x) 在训练集上拟合残差 rim 。
更行模型: Fm(x) = F(m-1)(x) +α hm(x) ,其中是一个学习率(也称为步长),控制每次迭代新模型的贡献程度。
最终模型为FM(x) 。

3. 利用梯度提升树分类法实现乳腺癌数据集分类实验

3.1 乳腺癌数据集介绍

威斯康星州乳腺癌数据集是scikit-learn(sklearn)库中一个常用的内置数据集,用于分类任务。该数据集包含了从乳腺癌患者收集的肿瘤特征的测量值,以及相应的良性(benign)或恶性(malignant)标签。以下是对该数据集的简单介绍:
数据集来源:数据集最初由威斯康星州医院的Dr. William H. Wolberg收集。
数据集大小:569 个样本,其中良性样本357个,恶性样本212个
特征数量:30 个数值特征
特征名称:每个特征表示从乳腺细胞核图像中提取的一个属性。以下是特征的具体描述:
• 半径(mean radius)
• 纹理(mean texture)
• 周长(mean perimeter)
• 面积(mean area)
• 平滑度(mean smoothness)
• 紧致度(mean compactness)
• 凹陷点(mean concavity)
• 凹点数(mean concave points)
• 对称性(mean symmetry)
• 分形维数(mean fractal dimension)
以上特征的计算方式包括平均值(mean)、标准误(standard error)、最大值(worst),每个特征的这三种计算方式形成了30个特征。

3.2 实验过程

下面展示一些 内联代码片

pip install numpy pandas scikit-learn matplotlib seaborn -i 
https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

numpy: 用于处理数值计算
pandas: 用于数据处理和分析
scikit-learn: 加载乳腺癌数据集
Matplotlib:提供基础的绘图功能,如线条图、散点图、柱状图等,支持广泛的图表类型和自定义,可以创建静态图形以及一些动态和交互式图形。
Seaborn:基于Matplotlib,提供更高级的数据可视化功能,如时间序列数据的静态图表,自动图形美化,特别适合统计数据可视化
1 首先导入相关库

# 导入库
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_breast_cancer
from sklearn.model_selection import train_test_split, GridSearchCV
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier
from sklearn.metrics import classification_report, confusion_matrix, accuracy_score
import seaborn as sns

2 数据加载和预处理,将特征数据存储在 DataFrame 中,标签数据存储在 Series 中,使用StandardScaler 对特征数据进行标准化处理,以确保特征值在同一量级。

# 导入库
data = load_breast_cancer()
X = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names)
y = pd.Series(data.target)
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

3 将数据集划分为训练集和测试集 训练集70% 、测试集30%

X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_scaled, y, test_size=0.3, random_state=42)

4 使用 Gradient Boosting Classifier 进行模型训练

gbc = GradientBoostingClassifier(random_state=42)
gbc.fit(X_train, y_train)

5 使用测试集进行模型评估

y_pred = gbc.predict(X_test)
print("初始模型评估:")
print(classification_report(y_test, y_pred))
print("混淆矩阵:")
print(confusion_matrix(y_test, y_pred))
print("准确率:", accuracy_score(y_test, y_pred))

6优化参数:网格搜索使用 5 折交叉验证评估每个超参数组合,总共有 64 种超参数组合,因此需要进行 320 次模型训练和验证,得到最佳参数。

param_grid = {'n_estimators': [50, 100, 150, 200],'learning_rate': [0.01, 0.05, 0.1, 0.2],'max_depth': [3, 4, 5, 6]
}
rid_search = GridSearchCV(estimator=gbc, param_grid=param_grid, cv=5, n_jobs=1, verbose=2)
grid_search.fit(X_train, y_train)
print("最佳参数:", grid_search.best_params_)

7 优化后的模型评估

best_gbc = grid_search.best_estimator_
y_pred_best = best_gbc.predict(X_test)
print("优化后模型评估:")
print(classification_report(y_test, y_pred_best))
print("混淆矩阵:")
print(confusion_matrix(y_test, y_pred_best))
print("准确率:", accuracy_score(y_test, y_pred_best))

8 混淆矩阵可视化

conf_matrix = confusion_matrix(y_test, y_pred_best)
plt.figure(figsize=(10, 7))
sns.heatmap(conf_matrix, annot=True, fmt='d', cmap='Blues', xticklabels=data.target_names, yticklabels=data.target_names)
plt.xlabel('Predicted')
plt.ylabel('True')
plt.title('Confusion Matrix')
plt.show()

9 特征重要性可视化

feature_importances = best_gbc.feature_importances_
features = data.feature_names
indices = np.argsort(feature_importances)
plt.figure(figsize=(15, 10))
plt.title('Feature Importances')
plt.barh(range(len(indices)), feature_importances[indices], color='b', align='center')
plt.yticks(range(len(indices)), [features[i] for i in indices])
plt.xlabel('Relative Importance')
plt.show()

3.3 实验结果

得到最佳参数:学习率0.05、决策树的最大深度3、决策树的数量200
模型分类准确率为96%,如果计算机内存够大,可通过设置参数n_jobs=2/3/4得到更高准确率。
在这里插入图片描述
混淆矩阵可视化图
0 代表恶性(Malignant)1 代表良性(Benign)
59:表示模型将真实为类别0的样本预测为类别0的数量
105:表示模型将真实为类别1的样本预测为类别1的数量
3:表示模型将真实为类别1的样本错误地预测为类别0的数量
4:表示模型将真实为类别0的样本错误地预测为类别1的数量
在这里插入图片描述
特征重要性图
这些特征的重要性分布揭示了在乳腺癌分类问题中,某些特征(如半径、周长和面积)比其他特征(如平滑度、对称性)更有影响力。理解这些特征的重要性有助于进一步改进模型,并且在实际应用中可能提供更多的临床意义
在这里插入图片描述

3.4 完整代码

# 导入库
import numpy as np    # 处理数值计算
import pandas as pd    # 数据处理和分析
from sklearn.datasets import load_breast_cancer   # 加载乳腺癌数据集
# 将数据集划分为训练集和测试集以及超参数搜索和交叉验证
from sklearn.model_selection import train_test_split, GridSearchCV
from sklearn.preprocessing import StandardScaler   # 数据标准化
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier   # 梯度提升树分类器模型
# 生成分类报告、混淆矩阵,计算准确率
from sklearn.metrics import classification_report, confusion_matrix, accuracy_score
# 绘制数据可视化图表
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt# 加载乳腺癌数据集
data = load_breast_cancer()
# 将特征数据存储在 DataFrame 中,标签数据存储在 Series 中
X = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names)
y = pd.Series(data.target)# 数据预处理
scaler = StandardScaler()   # 标准化特征值,使每个特征具有相同的尺度
X_scaled = scaler.fit_transform(X)# 数据分割 将数据集划分为训练集和测试集 训练集70%  测试集30%
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_scaled, y, test_size=0.3, random_state=42)# 使用梯度提升树分类器模型训练
gbc = GradientBoostingClassifier(random_state=42)
gbc.fit(X_train, y_train)# 使用测试集进行模型评估
y_pred = gbc.predict(X_test)
print("初始模型评估:")
print(classification_report(y_test, y_pred))
print("混淆矩阵:")
print(confusion_matrix(y_test, y_pred))
print("准确率:", accuracy_score(y_test, y_pred))# 模型优化  决策树的数量  学习率   决策树的最大深度
param_grid = {'n_estimators': [50, 100, 150, 200],'learning_rate': [0.01, 0.05, 0.1, 0.2],'max_depth': [3, 4, 5, 6]
}grid_search = GridSearchCV(estimator=gbc, param_grid=param_grid, cv=5, n_jobs=1, verbose=2)
grid_search.fit(X_train, y_train)print("最佳参数:", grid_search.best_params_)# 优化后的模型评估
best_gbc = grid_search.best_estimator_
y_pred_best = best_gbc.predict(X_test)
print("优化后模型评估:")
print(classification_report(y_test, y_pred_best))
print("混淆矩阵:")
print(confusion_matrix(y_test, y_pred_best))
print("准确率:", accuracy_score(y_test, y_pred_best))# 混淆矩阵可视化
conf_matrix = confusion_matrix(y_test, y_pred_best)
plt.figure(figsize=(10, 7))
sns.heatmap(conf_matrix, annot=True, fmt='d', cmap='Blues', xticklabels=data.target_names, yticklabels=data.target_names)
plt.xlabel('Predicted')
plt.ylabel('True')
plt.title('Confusion Matrix')
plt.show()# 特征重要性可视化
feature_importances = best_gbc.feature_importances_ # 包含了每个特征的相对重要性
features = data.feature_names  # 所有特征名称
# 返回一个数组,数组元素按特征重要性从小到大的顺序排列
indices = np.argsort(feature_importances)
# 绘制特征重要性图
plt.figure(figsize=(15, 10))
plt.title('Feature Importances')
plt.barh(range(len(indices)), feature_importances[indices], color='b', align='center')
plt.yticks(range(len(indices)), [features[i] for i in indices])
plt.xlabel('Relative Importance')
plt.show()

4. 参考文献

机器学习之梯度提升决策树(GBDT)-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com): link
GBT、GBDT、GBRT与Xgboost - 别再闹了 - 博客园 (cnblogs.com): link

这篇关于利用梯度提升树分类法实现乳腺癌数据集分类的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1040376

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