本文主要是介绍KEGG 下载 Pathway 通路数据,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
- 进入KEGG物种列表,网址:https://www.kegg.jp/kegg/catalog/org_list.html
-
这里以小鼠为例,点击
Ctrl
+F
查找物种小鼠的拉丁名Mus musculus
这里也可以用
mouse
来搜索,不过可以看到在kegg中含有三种鼠的信息。为了信息准确,最好使用拉丁名作为搜索条件。 -
点击
Brite hierarchy
-
进入
KEGG Orthology (KO)
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KEGG Orthology 提供了两种可供下载的格式,比如下载
htext
格式如果提示连接不到网络,可以多次点击,国外网的原因。。。
-
htext
格式如下 -
下载
json
格式 -
json
格式如下,这种格式更适合提取数据
这篇关于KEGG 下载 Pathway 通路数据的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!