本团队提供生物医学领域专业的AI（机器学习、深度学习）技术支持服务。如果您有需求，请扫描文末二维码关注我们。 在对氨基酸序列数据进行深度学习模型构建时，首先需要将字符形式的序列数据进行编码操作。最简单的当然是One-hot编码，但会引入稀疏性问题。这里提供一种基于预训练模型的编码方法，代码如下： import os import pandas as pd import numpy

🌞欢迎来到生物化学的世界  🌈博客主页：卿云阁 💌欢迎关注🎉点赞👍收藏⭐️留言📝 🌟本文由卿云阁原创！ 📆首发时间：🌹2024年3月24日🌹 ✉️希望可以和大家一起完成进阶之路！ 🙏作者水平很有限，如果发现错误，请留言轰炸哦！万分感谢！ 目录 蛋白质的水解 L-α-氨基酸的结构通式 氨基酸的分类 氨基酸的酸碱化学 氨基酸的化学反应 氨基酸的物理性质 蛋白质的水解 蛋白

体外受精： 体外受精技术对动物生殖机理研究、畜牧生产、医学和濒危动物保护等具有重要意义。如用小鼠、大鼠或家兔等作实验材料，体外受精技术可用于研究哺乳动物配子发生、受精和胚胎早期发育机理。在家畜品种改良中，体外受精技术为胚胎生产提供了廉价而高效的手段，对充分利用优良品种资源，缩短家畜繁殖周期，加快品种改良速度等有重要价值。在人类，IVF-ET技术是治疗某些不孕症和克服性连锁病的重要措施之一。体外受

名称：三黄汤联合复方氨基酸脂质体 纯度：95%+ 存储条件：-20°C，避光，避湿 三黄汤"通常是指中医中的一种草药方剂，联合复方氨基酸脂质体则可能是将这个中草药方剂与复方氨基酸脂质体结合在一起的复合物。 三黄汤的制备： 提取三黄汤中的草药成分，可能包括黄芩、黄连、黄柏等。按照传统中药制备方法，将这些草药进行煎煮或其他处理，得到三黄汤。 复方氨基酸脂质体的制备： 准备复方氨基酸脂质体的组分，

对于蛋白质序列中的每个位置，从 protein['msa']特征计算氨基酸（22种，包括X和gap）的概率值，从而得到protein['hhblits_profile']特征，protein['msa']先进行one-hot转化再reduce_mean计算。 import pickleimport tensorflow as tfdef make_hhblits_profile(protei

特征编码： 1. 基于序列的特征：  资料来源： 蛋白质序列特征提取方法之——CKSAAP 1.1 CKSAPP（k空间氨基酸对的组成）： 在CKSAAP(Compositon of k-spaced Amino Acid Pairs)方法中，利用在蛋白质序列片断中k个间隔距离的残基对(residue pairs)在该序列中的组成比例，建立数学模型，提取出特征向量，从而达到预测泛素(Ub

蛋白质中的"chi角"（chi angle）通常是指侧链自由旋转的二面角，用于描述氨基酸侧链中的旋转构象。侧链是氨基酸分子的一部分，它们附着在氨基酸主链上，并可以以不同的角度自由旋转。chi角用于描述侧链旋转的几何构象。 不同氨基酸的侧链具有不同数量的chi角，通常分为chi1、chi2、chi3、chi4等。每个chi角表示了侧链上的一个二面角，通常是在侧链的主要链或原子之间的角度。 Chi

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FITC是生物学应用的一种绿色荧光素衍生物，其异硫氰酸基团能与蛋白上的氨基末端和首胺反应，从而将荧光素标记到蛋白上，包括抗体和凝集素。FITC的生物应用包括蛋白的荧光标记，蛋白的荧光示踪，以及荧光抗体的病原体快速鉴定技术。FITC的大吸收波长为495nm，呈黄-橙色；大发射波长为525nm，呈黄-绿色。Hydroxycholesterol是胆固醇的代谢产物，由巨噬细胞响应Toll样受体(TLR)激