目录 4.3 问题 3 的建模与求解 4.3.1 备选基因的筛选 4.3.2 利用决策树预测

1.命名空间 命名空间是什么？ 1).命名空间在PHP 5.3中被引入，类似于文件夹的功能。例如Symfony框架中的Request和Response，位于Symfony的命名空间下。 2).命名空间始终应该在 为什么需要命名空间？ 1).命名空间使得程序可以像沙盒一样运行，可以和其他开发者编写的代码一起使用。确保了自己的代码和项目可以和项目的第三方依赖一起使用。 声明命名空间 1)

同学给我看了她参加竞赛的题目，我一看，这不巧了吗，我也就看看题目...... 人体的每条染色体携带一个DNA分子。在这条双螺旋的长链中，共有约30亿个碱基对，而基因则是DNA长链中有遗传效应的一些片段。在组成DNA的数量浩瀚的碱基对（或对应的脱氧核苷酸）中，有一些特定位置的单个核苷酸经常发生变异引起DNA的多态性，我们称之为位点。 在DNA长链中，位点个数约为碱基对个数的1/1000。

0. 飞哥感言 这篇文章，主要是介绍了抗性数据，如何利用GLMM模型进行的分析，文中，他将9级分类性状变为了二分类性状，进行分析。 分析中用到了加性效应（A矩阵），空间分析（行列信息）。 对比了SAS和ASReml，结果基本一致。 其实，9分级性状，可以直接使用ASReml进行有序多分类性状分析，用累计Logistic模型分析，也可以考虑系谱数据和空间位置信息。这样效果应该更好。 回头找

大家好，我是邓飞。 GWAS分析时，3~5个性状是正常操作，要分析100个性状呢，手动修改参数，工作量是够了，但是程序员的修养体现在哪里了？？？ 如果还是按照每个性状一个文件夹，每个文件夹中一个脚本，不断地修改脚本，一点也不高端，所以，遇到这种情况，批量处理就派上用场了。 之所以之前一直不用，因为10个性状一下，没有必要，费心思想还不如直接动手操作了，但是100个性状真的吓到我了，不满足才能

（一）BSA基本概念 BSA即集群分离分析法，是Bulked-Segregant Analysis的首字母缩写。具体是利用差异目标性状的两个亲本构建家系，在子代分离群体中选取目标性状个体构建DNA混合池，采用高通量测序技术对混池DNA进行建库测序，开发全基因组范围内的SNP、InDel分子标记，以通过计算SNP、InDel的基因型频率，在基因组范围内检测与目标性状相关联的位点与基因，然后对候选基