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Nature Communications: 使用自然语言处理解密微生物基因功能
Nature Communications: 使用自然语言处理解密微生物基因功能 1. 摘要 通讯作者为:以色列特拉维夫大学的David (Dudu) Burstein 在测序数据量不断增加的时代,揭示未表征基因的功能是一项基本挑战。在这里,我们提出了一个使用自然语言处理(NLP)中采用的深度学习方法来应对这一挑战的概念。我们重新调整了NLP算法的用途,以基于其基因组背景下超过3.6
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R语言基因功能富集分析气泡图
文章目录 前言一、基因本体论介绍二、数据获得三、气泡图绘制四、参考 前言 大家好✨,这里是bio🦖。有一位粉丝询问我如何绘制基因功能富集分析图,简单了解过后发现这是gene ontology(基因本体论)有关的知识,之前从未了解过。于是想写篇博客记录一下新知识以及第一次教粉丝绘图。 看完本篇博客,你将学习到: 1. 什么是基因本体论 2. 如何绘制基因功能富集分析图
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遗传转化在基因功能研究中的应用VaERD15基因与葡萄的耐寒性
赛思基因(www.scientsgene.com),专注遗传转化技术的应用于开发,致力于打破基因型限制,助力基因编辑育种。 一文带您了解遗传转化技术在基因功能研究中的应用——VaERD15基因与葡萄的耐寒性 ABSTRACT: 在植物中,脱水早期响应 (Early Responsive to Dehydrationm, ERD) 基因在响应干旱和其他非
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融合基因功能预测数据库
FusionGDB (地址见文末) 1 数据库分析流程 由于要分析融合基因的功能,所以第一步就是要选择分析哪些融合基因的功能。这里作者纳入了三个数据库当中和肿瘤相关的融合基因。这三个数据库分别是ChiTaRS 3.1、TumorFusions以及一篇基于TCGA分析融合基因文章(pmid: 29617662)。最终收集到了48000个融合基因,进一步作者对这这些融合基因进行肿瘤相关的
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