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如何快速从基因组中提取基因、转录本、蛋白、启动子、非编码序列?
有读者留言想要提取外显子,内含子,启动子,基因体,非编码区,编码区,TSS上游1500,TSS下游500的序列。下面我们就来示范如何提取这些序列。 NGS基础 - 参考基因组和基因注释文件提到了如何下载对应的基因组序列和基因注释文件。 假如我们已经拿到了基因组序列文件GRCh38.fa和基因注释文件GRCh38.gtf,也可从文后链接获取。 查看下文件内容和格式 基因组序列文件为FASTA
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DeepLncPro:用于识别长非编码RNA启动子的可解释卷积神经网络模型
论文题目: DeepLncPro: an interpretable convolutional neural network model for identifying long non-coding RNA promoters 期刊:Briefings in Bioinformatics 论文链接:https://doi.org/10.1093/bib/bbac447 代码链接: https
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servlet不能映射为一个url模式、启动子级时出错、工件 request:war: 部署工件时出错。请参阅服务器日志了解详细信息解决方案
测试response时出现这样的情况,网上说删除这个文件再Maven刷新,但是不可行 然后我仔细检查了一下代码,发现我犯了一个低级错误,因为Demo3是直接复制Demo2的,所以访问路径忘了修改 跟Demo2的一样,所以报错,修改后就可以正常运行了!
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