欢迎浏览我的CSND博客！ Blockbuater_drug …点击进入 文章目录 前言一、Mol2文件示例二、 Mol2文件主要结构解释及注意事项MOLECULE 字段解释ATOM 字段解释BOND 字段解释SUBSTRUCTURE字段解释 总结参考资料 前言 Mol2格式文件是一个ASCII 文件，由Tripos公司编制的用于表示化学分子的文件格式，在其药物设计

硬核原创，转载请注明出处： https://leytton.blog.csdn.net/article/details/130406553 一、前言 在用Pytorch图神经网络对化学分子进行数据分析的时候，经常使用现有的数据集。看到自动处理完毕的数据结构，里面的特征值让我们一脸懵逼，不知道代表的是什么含义。本文将带大家分析这些数据结构的来龙去脉。 二、数据原始特征 在使用图神经网络（GN

首先，关于分子指纹，分子指纹是一个二进制向量，其中每个位代表是否存在该分子的某个子结构 ，例如苯环。 它通常很长，可能无法合并一些结构信息，例如手性 。 '''使用Deepchem构建化学分子的神经网络和图神经网络模型示例by wufeilDeepchem包含了很多的化学分子的数据集，同时也有将分子结构转换为机器学习能够识别的矩阵（序列）数据的方法，下面就来简单举几个例子，以便快速入门'''i