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Bisulfite Sequencing
全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing) 表观遗传学研究已经证实了特定基因区域的DNA甲基化修饰对于染色体构象、基因表达调控机制有着重要影响,而全基因组DNA甲基化研究将是表观基因组学最为关注的内容之一。 Bisulfite处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再
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java 工作排序(Job Sequencing Problem)
给定一个作业数组,其中每个作业都有一个截止期限,如果作业在截止期限之前完成,则可获得相关利润。此外,每个作业都占用一个单位时间,因此任何作业的最小可能截止期限都是 1。如果一次只能安排一项作业,则最大化总利润。 例子: 输入:四个工作,截止日期和利润如下 JobID 截止期限 利润 一 4 20 二 1 10 三 1 40 四 1 30 输出:以下
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next-generation sequencing analysis method——paper1
半路出家会有很多困惑,我想若要踏实基础,一步步了解二代测序所有过程,读paper应该是正统。因此今天在Web of Science中检索"next-generation sequencing analysis method",找到多篇关于二代测序的发展历史,分析方法及应用等方面的文章,并在读后记录下来心得,应该会有所提高。 第一篇: 来自于:Omics Technologies and Bi
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使用SHOREmap做mapping-by-sequencing
简介 SHOREmap可以用来分析传统作图群体(自然系natural strains和分化系,diverged accession杂交,或outcrossing)或近等作图群体(isogenic mapping population, 诱变后代与未诱变亲本进行杂交,即会交,backcrossing)所产生的重测序数据。根据作图群体构建方式的不同,SHOREmap的outcross或backcro
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