seq2hla专题

seq2HLA:利用RNA_seq数据进行HLA分型

欢迎关注"生信修炼手册"! 对于不同的HLA Allel来说,exon2和exon3 序列的差异性尤为明显,很多的HLA 分型软件都会根据这部分序列,整理出HLA Allel序列参考数据库。 seq2HLA也采用了类似的策略,通过HLA不同Allel的exon2和exon3的序列,整理了一份HLA参考数据库,通过将RNA_seq的reads与该数据库比对,确定HLA分型结果,原理示意图如下 迭