pfastq专题

生信软件21 - 多线程拆分NCBI-SRA文件工具pfastq-dump

在使用NCBI 工具fastq-dump拆分SRA文件时,拆分速度慢, fastq-dump拆分参数说明: –split-spot: 将双端测序分为两份,存放在同一个文件中–split-files: 将双端测序分为两份,存放在不同的文件,但是对于一方有而一方没有的reads直接丢弃–split-3 : 将双端测序分为两份,存放在不同的文件,但是对于一方有而一方没有的reads会单独放在一个文件