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单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 整合
引言 在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。 加载包 首先加载 Signac、Seurat 和我们将用于分析人类数据的其他一些包。 if (!requireNamespace("EnsDb.Hsapiens.v75", quietly = TRUE)) BiocManager::install("Ens
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人类PBMC的简介
外周血单核细胞(Peripheral blood monoculear cell, PBMC), 包括淋巴细胞(T细胞,B细胞和自然杀伤(NK)细胞)和单核细胞。而红细胞和血小板没有细胞核,而粒细胞(granulocytes) 包括中性粒细胞、嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞,有多叶核,所以不包括在PBMC中。 人类的PBMC主要由淋巴细胞组成,之后是单核细胞以及一小部分的树突状细胞(dendriti
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