分以下几个部分： CLR组装 HIFI组装 ONT组装 二、三代数据矫正 组装结果评估 一、CLR组装 下机数据： 主要用那个bam文件 软件：wtdbg2 第一步：bam转fasta文件 参考：https://www.jianshu.com/p/03c7eb11102d # 进行基因组装wtdbg2 -t 40 -i test.subreads.bam.fasta -fo test -

欢迎浏览我的CSND博客！ Blockbuater_drug …点击进入 文章目录 前言一、 软件及操作环境二、研究目的三、结构文件准备四、 DOCK中 de novo design4.1 generic de novo design4.2 Rescoring the Outputs对输出重新评分 五、 De Novo Refinement准备配体运行Refinement查看结果

欢迎关注"生信修炼手册"！ de novo mutation 是属于生殖细胞突变中的一类突变，指的是在一个家系中，第一次出现的突变。这个突变在父本中是没有的，只是在子代中第一次出现。 在varscan中，专门有一个子命令trio, 用来分析de novo突变。需要3个bam文件，分别对应faher, mother, child，同时还需要参考基因组的fasta序列。用法如下 第一步：生成mpil