nibabel专题

python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件

nii.gz格式是医学图像常用的压缩格式,python中可用nibabel和sitk来读取保存。 使用nibabel 由于使用nibabel图像会旋转90度,所以读取保存的时候还得保存映射信息,3维图像格式为(z, x, y) 读取nii.gz文件 img = nib.load('xxxxx.nii.gz')img_affine = img.affineimg = img.get_d

anaconda 安装 nibabel

anaconda 安装 nibabel 直接使用 conda install nibabel 是没法安装的,查阅官网(https://anaconda.org/conda-forge/nibabel)可知,应当运行以下四个命令中的任意一个即可。 conda install -c conda-forge nibabelconda install -c conda-forge/label/