hhsearch 是 HMM-HMM（Hidden Markov Model to Hidden Markov Model）比对方法的一部分，属于 HMMER 软件套件。它用于进行蛋白质序列的高效比对，特别适用于检测远缘同源性。 以下是 hhsearch 的一些主要特点和用途： HMM-HMM比对： hhsearch 使用隐藏马尔可夫模型（HMM）来表示蛋白质家族的模型。与传统的序列-序列比

hhsearch 是 HMM-HMM（Hidden Markov Model to Hidden Markov Model）比对方法的一部分，属于 HMMER 软件套件。它用于进行蛋白质序列的高效比对，特别适用于检测远缘同源性。 以下是 hhsearch 的一些主要特点和用途： HMM-HMM比对： hhsearch 使用隐藏马尔可夫模型（HMM）来表示蛋白质家族的模型。与传统的序列-序列比