gatk4专题

GATK4 somatic mutations analysis

Section 1 用Mutect2调用体细胞突变 Section 2 概述如何使用Mutect2的纯肿瘤模式创建panel of normal resource Section 3 概述了如何估计交叉样本污染 Section 4 显示了如何用FilterMutectCalls过滤callset。与GATK3不同,GATK4中,体细胞调用和过滤由不同的工具来体现 Section 5 显