dump专题

如何使用fastq-dump转换SRA格式

如何使用fastq-dump转换SRA格式 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打过交道,尤其是fastq-dump大家肯定不陌生.NCBI的fastq-dump软件一直被大家归为目前网上文档做的最差的软件之一”,而我用默认参数到现在基本也没有出现过什么问题,感觉好像也没有啥问题, 直到今天看到如下内容, 并且用谷歌搜索的时候,才觉得大家对fastq-dump的评价非常很到位. 我们一般使用

关于“程序闪退,没有生成DUMP文件”的一点总结

今早一回到公司,测试的同事就反映,昨晚程序运行一段时间后闪退了。。。。闪退???额,好吧,幸好我有加写DUMP的代码,示例如下: LONG WINAPI UnhandledExceptionFunction(_EXCEPTION_POINTERS* pExceptionInfo){SYSTEMTIME st;GetLocalTime(&st);CString time_now = _T("")

oracle的dump函数应用

一、函数用法     函数的标准格式是:DUMP(expr[,return_fmt[,start_position][,length]])     基本参数时4个,最少可以填的参数时0个,当完全没有参数时,直接返回null。另外3个参数也都有各自的默认值,一个一个来看:      expr:这个参数是要进行分析的表达式(数字或字符串等,可以是各个类型的值)    re

书生笔记-DUMP线程查找和过滤GTID的基本算法

《深入理解MySQL主从原理32讲》-学习笔记 主库DUMP线程有几步需要比较GTID和GTID SET: 1,检查从库的GTID SET是否大于主库的GTID SET 2,根据主库的gtid_purged变量检查从库需要的event是否已经被清理 3,实际扫描的主库的binary log 检查从库需要的event是否已经被清理 4,进行GTID过滤,决定发送哪些事务给从库 之前讲的是

书生笔记-mysql主库dump线程

《深入理解mysql主从原理32讲》学习笔记 每一个mysql的从库slave都会对于一个 dump线程,如上图的 Binlog Dump GTID . 实际上在启动之前还会和从库的IO线程进行多次的语句交互,然后注册从库,最后才是进行DUMP线程的启动。这些内容会在后续的IO线程中讲解,这里主要讨论的是POSITION MODE模式和GTID AUTO_POSITION MODE模式下的

查看jvm的dump快照文件方法

1、在dos窗口输入jvisualvm(jdk自带工具)命令,打开VisualVm客户端                                                                       打开命令

你开发的软件不知道哪里跑飞闪退了?这个办法可以帮忙定位(查看dump)

QT生成dump、pdb文件,使用windbg打开分析查看堆栈,定位程序崩溃位置。 《你开发的软件不知道哪里跑飞闪退了?这个办法可以帮忙定位》: https://zhuanlan.zhihu.com/p/102103083

PHP 输出字符串(echo,print,printf,sprinf,print_r,var_dump)

本篇文章是对php输出echo、print、print_r、printf、sprintf、var_dump的区别进行了详细的分析介绍。 一、echo echo() 实际上不是一个函数,而是一条php语句,因此无需对其使用括号。不过,如果您希望向 echo() 传递一个以上的参数,那么使用括号会发生解析错误。而且echo是返回void的,并不返回值,所以不能使用它来赋值。 例子: 1

JProfiler 性能分析案列——基于 dump.hprof 堆内存快照文件分析排查内存溢出

在 windows 环境下实现。 一、配置 JVM 参数 配置两个 JVM 参数: -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError,配置这个参数,会在发生内存溢出时 dump 生成内存快照文件(xxx.hprof)-XX:HeapDumpPath=F:\logs,指定生成内存快照文件的路径。 为了测试方便,将堆内存设置小一点 -Xms512m,设置堆内存空间下限。-Xmx

使用VS调试Dump文件

(一) 调试Dump文件步骤 1. 准备调试所需要的文件放到一个文件夹:dump文件,程序编译生成的pdb文件(版本必须是产生崩溃的那个版本的编译信息),可执行文件(发生崩溃的版本)。如下图: 2. 使用visual studio打开上图中的dump文件。然后配置该程序的代码路径(代码会滚到该程序所处的版本),如下图, 3. 点击调试,如图, 4. 然

JProfiler 性能分析案列——dump.hprof 堆内存快照文件分析排查内存溢出

在 windows 环境下实现。 一、配置 JVM 参数 配置两个 JVM 参数: -XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError,配置这个参数,会在发生内存溢出时 dump 生成内存快照文件(xxx.hprof)-XX:HeapDumpPath=F:\logs,指定生成内存快照文件的路径。 为了测试方便,将堆内存设置小一点 -Xms512m,设置堆内存空间下限。-Xmx

pWindow下程序使用CrashPad库生成dump并定位代码

Window下程序使用Crashpad库生成dump并定位代码 1 前言2 CrashPad介绍3 CrashPad原理4 环境准备与资源下载4.1 下载CrashPad源码并编译4.2 下载CrashPad编译好的库4.3 其他资源 5 集成CrashPad到项目中5.1 使用CMake集成5.2 使用QMake集成5.3 初始化CrashPad5.4 生成dump文件 6 分析dump文

JVM dump和分析

原文链接:https://www.dubby.cn/detail.html?id=9098 1、dump jmap -dump:live,format=b,file=~/Desktop/dump.hprof 1110 其他参数意义: Usage:jmap [option] <pid>(to connect to running process)jmap [option] <executa

core dump核心转储

检查核心转储是否开启,否则无法生成core文件 ulimit -a 如果为0就需要修改 ulimit -c 10240  写一个会触发core命令的程序 以浮点数运算为例  #include <iostream>int main(){int i = 1/0;} 在编译时使用-g选项 运行程序,生成core文件 gdb调试 gdb [进程名]

通过windbg查看dump文件中某个方法内的某个对象的变量的值

使用 WinDbg 和 SOS 扩展来查看 C# 应用程序生成的 dump 文件中某个方法中的某个对象的变量的值。以下是大致的步骤: 打开 WinDbg,并用它打开你的 dump 文件。你可以使用 File → Open Crash Dump 来实现。 在命令行中,加载 SOS 扩展。一般来说这可以通过 .loadby sos clr 来完成。如果这个不工作的话,你可能需要全路径来加载 SO

生产dump文件

方式1: 去下载DUILIB源码,里面的DEMO带的一个MINIDUMP的类使用十分方便,只用实例化一个对象就OK了,只有一句话,而且是动态加载DBGHELP.DLL文件 。如果机器没有不会产生错误。据说那个MINIDUMP是从电驴里面扣出来的,不知道是真是假.  使用方法: #include "MiniDumper.h" CMiniDumper g_miniDumper( true

生信软件21 - 多线程拆分NCBI-SRA文件工具pfastq-dump

在使用NCBI 工具fastq-dump拆分SRA文件时,拆分速度慢, fastq-dump拆分参数说明: –split-spot: 将双端测序分为两份,存放在同一个文件中–split-files: 将双端测序分为两份,存放在不同的文件,但是对于一方有而一方没有的reads直接丢弃–split-3 : 将双端测序分为两份,存放在不同的文件,但是对于一方有而一方没有的reads会单独放在一个文件

Python保存为json中文Unicode乱码解决json.dump()

保存为json中文Unicode乱码: 可以看到,中文字符没有乱码,只是出现了反斜杠,此时解决方法应考虑是否进行了二次序列化。 一、原因1 在dump时加入ensure_ascii=False 即可解决,即json.dump(json_data, f, indent=4, ensure_ascii=False) 二、原因2 json.dumps(data_dict, ensure_as

Visual Studio调试dump文件(Windows/C/C++)

调试之前务必确保: (a) 生成dump文件的程序版本和当前调试所用的程序版本完全一致(即pdb/源文件的时间戳、版本号等务必一致); (b)生成dump文件的程序名称务必要与当前调试所用的程序名称完全一致; 否则会报类似”…binary do not matchs…”错误 以下是调试步骤: 1、将dump文件拷贝到PDB所在目录; 2、打开vs菜单栏的Tools—-Options—-

SAP PP学习笔记 - 错误 CX_SLD_API_EXCEPTION - Job dump is not fully saved (too big)

我这个错误是跑完MRP,然后在MD04查看在库/所有量一览, 点计划手配(Planned order 计划订单)生成 制造指图(Production order 生产订单), 到目前这几步都OK,然后在制造指图界面点保存的时候报了错。 1,错误详细 错误如下: 実行時Error       UNCAUGHT_EXCEPTION 例外                   CX_SLD_

Java dump快照分析

dump文件获取 使用jmap 命令。其中首先需要获取进程id jmap -dump:format=b,file=heapDump <pid> 进程id获取命令 使用top命令,获取进程id top 使用jvisualvm分析 windows系统在cmd中执行 jvisualvm 启动jvisualvm jvisualvm 导入dump文件进行分析 点击文件-装入 点

DYNPRO_FIELD_CONVERSION dump error when a field is negative

错误出现场景: Table中数据有负数的情况时,当为此Table建立表维护生成器时,用TCODE:SM30打开时,出现错误:DYNPRO_FIELD_CONVERSION  dump error when a field is negative 解决方案: 在表维护生成器中,双击屏幕号 点击进入格式修改页面,勾选上“带符号”,这时候这一列就会出现“V”的标识,修改完成,这时候SM30

Core Dump和ulimit

什么是Core Dump? Core的意思是内存, Dump的意思是扔出来, 堆出来. 开发和使用Unix程序时, 有时程序莫名其妙的down了, 却没有任何的提示(有时候会提示core dumped). 这时候可以查看一下有没有形如core.进程号的文件生成, 这个文件便是操作系统把程序down掉时的内存内容扔出来生成的, 它可以做为调试程序的参考. core dump又叫核心转储, 当程

linux產生 core dump文件方法及設置

轉載自 http://younglibin.iteye.com/blog/1890701   1.core文件的生成开关和大小限制 ---------------------------------  1)使用ulimit -c命令可查看core文件的生成开关。若结果为0,则表示关闭了此功能,不会生成core文件。  2)使用ulimit -c filesize命令,可以限制cor

iOS安全攻防(六):使用class-dump-z分析支付宝app

为了了解支付宝app的源码结构,我们可以使用class-dump-z工具来分析支付宝二进制。 1.下载配置class_dump_z 前往 https://code.google.com/p/networkpx/wiki/class_dump_z ,下载tar包,然后解压配置到本地环境 $ tar -zxvf class-dump-z_0.2a.tar.gz   $

Android14音频进阶之dump各阶段音频数据<Tee Sink方案>(七十五)

简介: CSDN博客专家,专注Android/Linux系统,分享多mic语音方案、音视频、编解码等技术,与大家一起成长! 优质专栏:Audio工程师进阶系列【原创干货持续更新中……】🚀 优质专栏:多媒体系统工程师系列【原创干货持续更新中……】🚀 优质视频课程:AAOS车载系统+AOSP14系统攻城狮入门实战课【原创干货持续更新中……】🚀 人生格言: