complexheatmap专题

「热图」ComplexHeatmap展示单细胞聚类

实用Seurat自带的热图函数DoHeatmap绘制的热图,感觉有点不上档次,于是我尝试使用ComplexHeatmap这个R包来对结果进行展示。 个人觉得好的热图有三个要素 聚类: 能够让别人一眼就看到模式 注释: 附加注释能提供更多信息 配色: 要符合直觉,比如说大部分都会认为红色是高表达,蓝色是低表达 在正式开始之前,我们需要先获取一下pbmc的数据,Seurat提供了R包Seura

ComplexHeatmap绘图:注释、图例、热图基础(自备)

目录 基础介绍  Heatmap绘图基础参数 数据 作图参数 Heatmap Annotations(注释) 基础注释设置 简单注释测试 anno_points散点注释 anno_lines连线注释 anno_barplot条形图 anno_boxplot箱线图 anno_histogram直方图 热图组合 基础组合 进行调整(水平串联) 垂直串联(使用%v%连接)

ComplexHeatmap绘制Pathway热图

代码网址 GitHub https://github.com/jinhao94/Heatmap_practice 这是作者使用ComplexHeatmap绘制热图的一个练习,教程已经讲述的很详细。ComplexHeatmap包也是热图绘制中常使用的包,功能很强大。 感兴趣的可以在本教程中进行在优化,此教程总体算是比较繁琐,在平时使用过程中可以进行优化。 绘图代码 ##'@

学习ComplexHeatmap复杂热图

iMeta | 复杂热图(ComplexHeatmap)可视化文章最新版,画热图就引它_生信宝典的博客-CSDN博客 作者贡献 顾祖光:研究课题的提出和设计, 软件编写,可视化,数据分析,论文编写,修订和审阅。 代码和数据可用性 ComplexHeatmap 的稳定版本发布在 https://bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap/ 开发者版本发

DNA 6. 基因组变异之绘制精美瀑布图(ComplexHeatmap)

桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程,目前整理出来的教程目录如下: DNA 1. Germline Mutation Vs. Somatic Mutation 傻傻分不清楚 DNA 2. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools DNA 3. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools DNA 4. SCI 文章中基因组的突变信号(mafto