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CHAPERONg:基于GROMACS的分子动力学模拟和轨迹分析的自动化工具

此工作介绍了一个名为CHAPERONg的工具,它是一个自动化的GROMACS(一种广泛使用的分子动力学模拟软件)模拟和轨迹分析工具。CHAPERONg旨在简化和自动化蛋白质和蛋白质-配体系统的GROMACS分子动力学(MD)模拟流程,包括常规MD模拟、拉伸MD(steered MD)和增强型伞采样(umbrella sampling)模拟。这个工具通过集成GROMACS模块和第三方工具,提供