④-1单细胞学习-cellchat单数据代码补充版-CSDN博客 ④-2单细胞学习-cellchat单数据代码补充版（通讯网络）-CSDN博客 参考： 1：单细胞分析之细胞交互-3：CellChat - 简书 (jianshu.com) 2：CellChat细胞通讯分析（下）--实操代码·多个数据集比较分析 - 知乎 (zhihu.com)

目录 1，原理基础 流程 受体配体概念 方法比较 计算原理 2，数据 3，代码运行 1，原理基础 原文学习Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat - PMC (nih.gov) GitHub - sqjin/CellChat: R toolkit for inference, visual

cellchat教程第一弹，源代码来自于http://www.cellchat.org/ 不得不说，这个包的可视化做的真的很漂亮。狠狠喜欢了！ 第一部分： 数据准备创建对象 CellChat需要两个用户输入:一个是细胞的基因表达数据，另一个是用户分配的细胞标签(即基于标签的模式)或单细胞数据的低维表示(即无标签模式)。对于后者，CellChat根据低维空间或伪时间轨迹空间中的细胞-细胞距离构建