biopython专题

蛋白质PDB文件解析+建图(biopython+DGL)

PDB文件解析 PDB文件设计得非常好,能够比较完整地记录实验测定数据 读懂蛋白质PDB文件-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com) 科学网—PDB文件格式说明 - 李继存的博文 (sciencenet.cn) 从蛋白质结构来看,首先它会有多种不同的测定模型,然后每个模型中包含多条链,每条连上包含若干个残基,每个残基包含若干个原子 在biopython.PDB包中可以找到这

Biopython从NCBI搜索和取回数据库记录

Entrez模块 Entrez提供了链向在NCBI服务器的esearch和efetch工具的连接 列出Entrez模块的方法和属性 #!/usr/bin/env python# -*- coding: utf-8 -*-__author__ = 'sunchengquan'__mail__ = '1641562360@qq.com'from Bio import Entrezs