bioinfo专题

【bioinfo】bwa mem 比对分值参数测试

常用的序列比对软件bwa: command对应的多种命令,这里使用的是mem,即使用BWA-MEM算法进行序列比对。 bwa mem命令比对: 下方官网上介绍的mem命令: bwa mem 比对分值参数: 参数默认比对情况分值说明-A[1]Match11bp比对得1分-B[4]Mismatch-41bp错配扣4分-O[6,6]gap(ins,del)-6,-61bp的ins扣6分,d