basecalling专题

Guppy从nanopore下机fast5文件中进行basecalling时所需config文件的确定

使用Guppy进行basecalling时需要指定与芯片类型匹配的config文件。所有config文件均在Guppy软件的data文件夹下。如果已知所用芯片型号,则直接选择对应的config即可。若不知道(比如第三方测序的或者其他来源的),可以根据下机报告(一个***Run Report***.html文件)中的“Run configuration”部分查看: 可以看到这批数据用的flow