atacseq专题

从SRA数据下载开始学习ATACseq数据分析

1.打开NCBI GEO数据库找到你需要下载的数据页,打开SRA Run Selector,找到需要下载的原始数据的SRR编号。   2.创建一个txt文件并输入需要下载的SRR编号(好像SRA页面可以直接生成?待研究) vim sra.txt 3.prefetch命令进行数据下载(很慢,所以要放在后台下载,并且关闭shell窗口不影响) nohup prefetch

从SRA数据下载开始学习ATACseq数据分析

1.打开NCBI GEO数据库找到你需要下载的数据页,打开SRA Run Selector,找到需要下载的原始数据的SRR编号。   2.创建一个txt文件并输入需要下载的SRR编号(好像SRA页面可以直接生成?待研究) vim sra.txt 3.prefetch命令进行数据下载(很慢,所以要放在后台下载,并且关闭shell窗口不影响) nohup prefetch