fasta文件读取c++代码

2024-03-23 15:28
文章标签 代码 c++ 读取 fasta

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#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>using namespace std;
// 读取FASTA格式数据并存储到字符串向量中
void readFasta(const string& filename, vector<string>& sequences, vector<string>& sequenceInfo) {ifstream file(filename); // 打开文件string line;string currentSequence = "";string currentInfo = "";if (file.is_open()) {while (std::getline(file, line)) {if (line.empty()) {continue; // 忽略空行}if (line[0] == '>') { // 如果行以">"开头,则是序列信息行if (!currentSequence.empty()) { // 如果当前序列不为空,则将其存入序列向量sequences.push_back(currentSequence);sequenceInfo.push_back(currentInfo);currentSequence = ""; // 清空当前序列currentInfo = ""; // 清空当前序列信

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