服务器提交任务和直接运行,服务器端大批量提交计算任务的方法

引言服务器端批量提交任务

引言

许多科研活动涉及大量繁重的计算任务，如分子模拟，量化计算，数据分析等等。往往这些计算都由服务器来完成。大致的流程如下：

通常科学计算用服务器安装的都是linux等系统，且受限于网络速度，与用户的交互界面也是命令行式的(还记得dos吧)。在linux下，任何东西都是文件，任何事情都可以通过操作文件来实现。这是非常灵活的设计，方便我们定制一些特殊功能，利用好这些特性可以大大提高我们的工作效率。

在科研活动中，一个常用的研究方法是控制变量，通过改变一些变量的值来观察结果对变量的响应。具体到服务器的任务提交上，可能就会涉及到大量的大同小异的输入文件上。如果手工操作，一个文件一个文件的修改，然后一个任务一个任务的上传，这就浪费大家宝贵的生命了。

这里列举一个简单的例子来介绍处理这类任务一劳永逸的方法，归纳一下，就是批处理的思想。希望抛砖引玉对大家有所帮助。

总之，只要涉及到枯燥的步骤化的任务，立马就要想到用计算机去处理。

例子

假设我们需要研究氢分子的电子密度随原子之间距离的变化，利用开源软件GAMESS就能办到。这里重点不在介绍GAMESS的使用，重点是批量地生成输入文件与批量地提交一大帮任务的思想，所以大家对GAMESS的输入文件不熟悉也无关紧要。

服务器提交单个任务的细节