本文主要是介绍柳叶刀：港大研究发现新冠病毒可通过动物传人，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！
视学算法报道
编辑：拉燕 时光
【新智元导读】
香港这波疫情爆发，仓鼠也在其中添乱搞鬼？看看顶会「柳叶刀」上的专家怎么说。
香港疫情爆发的罪魁祸首之一，竟然是下面这个萌萌哒的小动物？
仓鼠带给人们欢乐、慰藉、陪伴，以及......
新冠病毒！
3月12日，医学顶级期刊「柳叶刀」上的一篇名为「案例研究：SARS-CoV-2型delta变异病毒（AY.127）从宠物仓鼠传播到人，引发人际传播」的论文引发热议。
这项研究由香港大学公共卫生学院严慧玲博士领衔，此外还有十多位研究人员合作完成。
这篇文章刷新了人们对于新冠病毒人-动物、动物-人、人-人之间的传播认识。
首次发现宠物传人
此前，新冠病毒人传动物，包括宠物的例子比比皆是。
然而，除了养殖的水貂之外，现在还没有证据表明，感染新冠病毒的动物会再传染给人，并导致持续的人际传播。
新冠病毒和其伴生毒株能传染除人类以外的很多物种。人传动物的案例已经有过很多记录，比如说传给猫猫狗狗这类宠物，或是家禽、野生动物什么的。
科学家也发现了一些极易感染病毒的物种，比如仓鼠、灵长类动物、猫、狗等等。
同时，动物之间的传播在仓鼠、雪貂、猫、果蝠等物种中也有发现。
动物间持续性的传播，以及新冠病毒在动物体内的不断进化也多有记录。比方说在水貂养殖场，以及白尾鹿间的爆发性疫情。
迄今为止，动物传人只在养殖水貂身上发生过。
然而最近，科学家却对动物和人之间的传播有了新的认识。
今年3月，香港一家宠物店里的员工确诊了新冠肺炎。在对宠物店内的宠物，以及库房供应链进行例行检测时，发现了不一样的东西。
他是被一只仓鼠传染的。
此前科学家曾表示，虽然在实验中发现仓鼠是一种易感新冠病毒的物种，但并没有任何实验以外的仓鼠感染病毒。
研究是如何进行的？
科学家提取了宠物店内宠物和库房中宠物的病毒拭子和血液样本。同时，还提取了相关病患的鼻拭子和唾液样本。检测发现，该新冠病毒属于德尔塔毒株。
随后研究人员通过定量的RT-PCR（RT-qPCR）对口腔拭子进行了病毒检测，并通过替代病毒中和试验（surrogate virus neutralisation test）和血小板减少中和试验（Plaque reduction neutralization test）对血液样本进行了血清检测。
所谓「RT-PCR（RT-qPCR）」，是指可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量，以及直接克隆特定基因的cDNA序列。
「替代病毒中和试验」是指用已知病毒测定待测血清中的中和抗体。
「血小板减少中和试验」主要检测了用于量化病毒中的抗体含量。
接着，科学家在ISeq测序平台（Illumina）上，利用下一代病毒全基因组测序，对新冠病毒RT-qPCR阳性样本进行了测序，同时对病毒的基因组进行了系统发育分析。
实验发现
通过从宠物店及其仓库2个地点采集样本，分别采集了125份和511份样本，检测发现，仓鼠身上共出现了8例新冠。
而其余的侏儒仓鼠、兔子、荷兰猪、毛丝鼠，以及老鼠，检测结果均不为阳性。
在进行了RT-qPCR或血清检测之后，宠物店内16只叙利亚大颊鼠（黄金鼠）中的8只（50%），以及相关联的库房内12只叙利亚大颊鼠中的7只（58%）新冠呈阳性。
在对患者和阳性的叙利亚大颊鼠进行病毒基因组推导后发现，感染的病毒均为德尔塔毒株，且在本次爆发前并未在本土进行传播。
在阳性仓鼠身上的病毒序列在系统发育上和某些序列异质性相关。
研究人员进一步对病毒进行了系统发育检测。数据显示，这些仓鼠大概在去年10月14日被感染。之后，多起人畜传染事件被检测出来，直接导致进一步的人传人。
科学家认为，宠物仓鼠天然可以感染新冠病毒。同时病毒会在鼠间进行传播，最终传染给人类。
基因学和病理学研究都充分表明，发生了不止一起鼠人传播的案例，并进一步导致人传人。染病仓鼠的进口也许就是本次疫情集中爆发的原因。
这项研究拓宽了人们对于新冠病毒的认知。自然界中的动物也能成为病毒宿主。
科学家认为，有必要提高人们的意识，应用合适的检疫隔离手段和防控政策，以减少人畜/畜人传播。
尽管仓鼠和人类感染的是同一毒株，但是具体还是有所区别。
仓鼠体内病毒的测序和最近众多欧洲国家检测出的AY.127病毒（即德尔塔）非常接近。然而，此前在一部分归国的香港人体内测出的德尔塔病毒，和这次爆发的病毒在基因上并无关联。
这直接证明了科学家的假设，他们认为本次疫情爆发的根源就是欧洲进口过来的仓鼠。
如何有效管理宠物？
上述研究中的宠物传人是研究人员进行溯源持续监测发现的，观察记录了1个月，记录了一家5位患者的活动轨迹，他们都与宠物店接触有关。
上表记录了自去年12月22日至今年1月20日，5位患者的活动轨迹，这5位患者分别是：1.宠物店工作人员，2.母亲，3.父亲，4.女儿，5.儿子，他们先后出现感染症状。
现在，研究证实宠物会传人，那么，在新冠疫情中如何管理宠物？这又给管理者增添了一项重任。
有网友认为，不能因为宠物传人，就将宠物感染者进行扑杀，而是主人应对宠物进行更好的管护。
对于已经感染的宠物，是否有必要进行救治？网友也展开了讨论。
看来，动物不光能感染新冠，还能再把病毒回传给人。
爱养宠物的人可得注意了，该有的防护不能少。
参考资料：
https://www.zhihu.com/question/527270662
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(22)00326-9/fulltext
https://www.npr.org/2022/03/02/1083881247/hamsters-in-hong-kong-are-euthanized-after-pet-shop-owner-gets-covid-19
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