lammps计算质心的两种方法

2024-03-10 04:28

本文主要是介绍lammps计算质心的两种方法,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

大家好,我是小马老师。
本文介绍lammps计算质心的两种方法。
在润湿、蒸发、烧结或者冲击模拟中,可能需要计算某个原子组的重心,以判断其移动速度或者相对运动的情况。
lammps提供了两种方法计算原子组的质心。
(1)xcm()函数
xcm(group-id,dim)函数可以计算group的质心的三个坐标,其中,dim表示质心坐标的方向(x、y、z)

variable x1 equal xcm(Cu,x)

以上命令返回原子组Cu在x方向的坐标x1。
(2)compute com命令
compute com命令同样可以计算原子组的质心,计算结果是一个矢量坐标

compute 1 Cu com

以上命令计算原子组Cu的质心,质心可通过c_1[*]或者c_1[1]、c_1[2]、c_1[3]输出。
下面的案例分别使用以上两种方法计算Cu球的质心x坐标,并对两个结果进行对比。

#模型参数设置
units metal  
dimension 3
boundary p p p
timestep 0.001
atom_style full
neighbor 2.0 bin
neigh_modify delay 0 every 1 check yes
lattice fcc 3.61
region box block -10 10 -10 10 -10 10
create_box 1 box
region cu sphere 0 0 0 10 units box
create_atoms 1 region cu
#势参数设置
pair_style eam/fs
pair_coeff * * Cu1.eam.fs Cu 
#原子分组
group Cu type 1
#计算重心
variable x1 equal xcm(Cu,x)
compute 1 Cu com
thermo 100
thermo_style custom step v_x1 c_1[1]
velocity all create 298 89898
dump 1 all atom 100 dump.xyz
fix 1 all nvt temp 298 298 0.1
run 1000

从结果可以看出,两种方法计算的质心坐标完全一致。

来源:公众号<lammps加油站>

这篇关于lammps计算质心的两种方法的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/793033

相关文章

Python使用Pandas对比两列数据取最大值的五种方法

《Python使用Pandas对比两列数据取最大值的五种方法》本文主要介绍使用Pandas对比两列数据取最大值的五种方法,包括使用max方法、apply方法结合lambda函数、函数、clip方法、w... 目录引言一、使用max方法二、使用apply方法结合lambda函数三、使用np.maximum函数

Qt 中集成mqtt协议的使用方法

《Qt中集成mqtt协议的使用方法》文章介绍了如何在工程中引入qmqtt库,并通过声明一个单例类来暴露订阅到的主题数据,本文通过实例代码给大家介绍的非常详细,感兴趣的朋友一起看看吧... 目录一,引入qmqtt 库二,使用一,引入qmqtt 库我是将整个头文件/源文件都添加到了工程中进行编译,这样 跨平台

Nginx设置连接超时并进行测试的方法步骤

《Nginx设置连接超时并进行测试的方法步骤》在高并发场景下,如果客户端与服务器的连接长时间未响应,会占用大量的系统资源,影响其他正常请求的处理效率,为了解决这个问题,可以通过设置Nginx的连接... 目录设置连接超时目的操作步骤测试连接超时测试方法:总结:设置连接超时目的设置客户端与服务器之间的连接

Java判断多个时间段是否重合的方法小结

《Java判断多个时间段是否重合的方法小结》这篇文章主要为大家详细介绍了Java中判断多个时间段是否重合的方法,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以跟随小编一起学习一下... 目录判断多个时间段是否有间隔判断时间段集合是否与某时间段重合判断多个时间段是否有间隔实体类内容public class D

Python使用国内镜像加速pip安装的方法讲解

《Python使用国内镜像加速pip安装的方法讲解》在Python开发中,pip是一个非常重要的工具,用于安装和管理Python的第三方库,然而,在国内使用pip安装依赖时,往往会因为网络问题而导致速... 目录一、pip 工具简介1. 什么是 pip?2. 什么是 -i 参数?二、国内镜像源的选择三、如何

IDEA编译报错“java: 常量字符串过长”的原因及解决方法

《IDEA编译报错“java:常量字符串过长”的原因及解决方法》今天在开发过程中,由于尝试将一个文件的Base64字符串设置为常量,结果导致IDEA编译的时候出现了如下报错java:常量字符串过长,... 目录一、问题描述二、问题原因2.1 理论角度2.2 源码角度三、解决方案解决方案①:StringBui

Linux使用nload监控网络流量的方法

《Linux使用nload监控网络流量的方法》Linux中的nload命令是一个用于实时监控网络流量的工具,它提供了传入和传出流量的可视化表示,帮助用户一目了然地了解网络活动,本文给大家介绍了Linu... 目录简介安装示例用法基础用法指定网络接口限制显示特定流量类型指定刷新率设置流量速率的显示单位监控多个

Java覆盖第三方jar包中的某一个类的实现方法

《Java覆盖第三方jar包中的某一个类的实现方法》在我们日常的开发中,经常需要使用第三方的jar包,有时候我们会发现第三方的jar包中的某一个类有问题,或者我们需要定制化修改其中的逻辑,那么应该如何... 目录一、需求描述二、示例描述三、操作步骤四、验证结果五、实现原理一、需求描述需求描述如下:需要在

JavaScript中的reduce方法执行过程、使用场景及进阶用法

《JavaScript中的reduce方法执行过程、使用场景及进阶用法》:本文主要介绍JavaScript中的reduce方法执行过程、使用场景及进阶用法的相关资料,reduce是JavaScri... 目录1. 什么是reduce2. reduce语法2.1 语法2.2 参数说明3. reduce执行过程

C#中读取XML文件的四种常用方法

《C#中读取XML文件的四种常用方法》Xml是Internet环境中跨平台的,依赖于内容的技术,是当前处理结构化文档信息的有力工具,下面我们就来看看C#中读取XML文件的方法都有哪些吧... 目录XML简介格式C#读取XML文件方法使用XmlDocument使用XmlTextReader/XmlTextWr