PyQt Python 使用 VTK ITK 进行分割 三维重建 医学图像可视化系统 流程

本文主要是介绍PyQt Python 使用 VTK ITK 进行分割 三维重建 医学图像可视化系统 流程,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

效果:

 重建流程:

1. 输入 可以读取DICOM ,nii nrrd 等数据

    设置读取器以加载 DICOM 图像系列。
    使用 itk::GDCMImageIO 作为 DICOM 图像的输入输出接口。
    使用 itk::GDCMSeriesFileNames 获取指定路径下的所有 DICOM 文件名。
    使用 itk::ImageSeriesReader 读取 DICOM 图像序列,并将其作为3D图像存储。

2.  分割

    创建 itk::ThresholdImageFilter 进行图像阈值分割。也可以使用 等高线分割,区域增加分割,AI 分割   

3. 连通性分析

    创建 itk::ConnectedComponentImageFilter 对分割后的图像进行连通性分析。
    对每个连通区域分配唯一的标签。
    获取标记(labeled)图像。
    获得连通性分析后的图像像素,后面就可以对像素做处理

 4. 选定区域处理

    遍历用户选定的点。
    对每个点,将屏幕坐标转换为图像坐标。
    从标记图像中提取每个点的标签值。
    将提取的标签值存储在列表中。

5. 转换为 VTK 图像

    将 ITK 图像转换为 VTK 的 vtkImageData。
    并部分不能颜色显示;
 
6. 创建并配置 VTK 体渲染器

    创建 vtkPolyDataMapper vtkActor 并设置输入数据。
    
    定义颜色 ,以及体属性。

7. 可视化

    创建 VTK 渲染器和渲染窗口。
    添加体对象到渲染器。
    设置背景色并重置摄像机。
    启动渲染窗口交互器以开始交互式查看。

8.输出 保存
   三维模型,可以进行单独保存,或全部保存

这个过程涵盖了从读取  医学图像、图像处理(阈值分割和连通性分析)、用户交互(选定区域处理)到最终的3D可视化。

视频:

PyQt Python VTK ITK 分割 三维重建

这篇关于PyQt Python 使用 VTK ITK 进行分割 三维重建 医学图像可视化系统 流程的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/708011

相关文章

python中各种常见文件的读写操作与类型转换详细指南

《python中各种常见文件的读写操作与类型转换详细指南》这篇文章主要为大家详细介绍了python中各种常见文件(txt,xls,csv,sql,二进制文件)的读写操作与类型转换,感兴趣的小伙伴可以跟... 目录1.文件txt读写标准用法1.1写入文件1.2读取文件2. 二进制文件读取3. 大文件读取3.1

Java使用SLF4J记录不同级别日志的示例详解

《Java使用SLF4J记录不同级别日志的示例详解》SLF4J是一个简单的日志门面,它允许在运行时选择不同的日志实现,这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用SLF4J记录不同级别日志,感兴趣的可以了解下... 目录一、SLF4J简介二、添加依赖三、配置Logback四、记录不同级别的日志五、总结一、SLF4J

将Java项目提交到云服务器的流程步骤

《将Java项目提交到云服务器的流程步骤》所谓将项目提交到云服务器即将你的项目打成一个jar包然后提交到云服务器即可,因此我们需要准备服务器环境为:Linux+JDK+MariDB(MySQL)+Gi... 目录1. 安装 jdk1.1 查看 jdk 版本1.2 下载 jdk2. 安装 mariadb(my

使用Python实现一个优雅的异步定时器

《使用Python实现一个优雅的异步定时器》在Python中实现定时器功能是一个常见需求,尤其是在需要周期性执行任务的场景下,本文给大家介绍了基于asyncio和threading模块,可扩展的异步定... 目录需求背景代码1. 单例事件循环的实现2. 事件循环的运行与关闭3. 定时器核心逻辑4. 启动与停

基于Python实现读取嵌套压缩包下文件的方法

《基于Python实现读取嵌套压缩包下文件的方法》工作中遇到的问题,需要用Python实现嵌套压缩包下文件读取,本文给大家介绍了详细的解决方法,并有相关的代码示例供大家参考,需要的朋友可以参考下... 目录思路完整代码代码优化思路打开外层zip压缩包并遍历文件:使用with zipfile.ZipFil

如何使用Nginx配置将80端口重定向到443端口

《如何使用Nginx配置将80端口重定向到443端口》这篇文章主要为大家详细介绍了如何将Nginx配置为将HTTP(80端口)请求重定向到HTTPS(443端口),文中的示例代码讲解详细,有需要的小伙... 目录1. 创建或编辑Nginx配置文件2. 配置HTTP重定向到HTTPS3. 配置HTTPS服务器

Python处理函数调用超时的四种方法

《Python处理函数调用超时的四种方法》在实际开发过程中,我们可能会遇到一些场景,需要对函数的执行时间进行限制,例如,当一个函数执行时间过长时,可能会导致程序卡顿、资源占用过高,因此,在某些情况下,... 目录前言func-timeout1. 安装 func-timeout2. 基本用法自定义进程subp

Python实现word文档内容智能提取以及合成

《Python实现word文档内容智能提取以及合成》这篇文章主要为大家详细介绍了如何使用Python实现从10个左右的docx文档中抽取内容,再调整语言风格后生成新的文档,感兴趣的小伙伴可以了解一下... 目录核心思路技术路径实现步骤阶段一:准备工作阶段二:内容提取 (python 脚本)阶段三:语言风格调

Python结合PyWebView库打造跨平台桌面应用

《Python结合PyWebView库打造跨平台桌面应用》随着Web技术的发展,将HTML/CSS/JavaScript与Python结合构建桌面应用成为可能,本文将系统讲解如何使用PyWebView... 目录一、技术原理与优势分析1.1 架构原理1.2 核心优势二、开发环境搭建2.1 安装依赖2.2 验

Java使用ANTLR4对Lua脚本语法校验详解

《Java使用ANTLR4对Lua脚本语法校验详解》ANTLR是一个强大的解析器生成器,用于读取、处理、执行或翻译结构化文本或二进制文件,下面就跟随小编一起看看Java如何使用ANTLR4对Lua脚本... 目录什么是ANTLR?第一个例子ANTLR4 的工作流程Lua脚本语法校验准备一个Lua Gramm