单倍型分析理解性问题，以及图如何看，2.0版本

本文主要是介绍单倍型分析理解性问题，以及图如何看，2.0版本，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！

在进行另外一个东西学习之前，我们得了解一下基本概念或者是背景。

一，什么是单倍型

1.1基本概念

先看一些文章，再看一个图片，相信能有一个很好的理解，

单倍型分析 - 简书 (jianshu.com)

参考基因组新时代 — “单倍型”参考基因组 - 简书 (jianshu.com)

生信:haplotype 单倍型分析全解，基于vcf文件进行基因单倍型分析 (qq.com)

单倍型甚至还有一个官网单倍型 (genome.gov)

Haplotype：

A haplotype is a physical grouping of genomic variants (or polymorphisms) that tend to be inherited together. A specific haplotype typically reflects a unique combination of variants that reside near each other on a chromosome.

SNP ：是指基因组上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。

单倍型(haplotype)：位于一条染色体上某一区域的一组相关联的多个SNP等位位点被称作单倍型。

比如，我还看到这种解释，更方便理解：两个材料的碱基序列比较，同一个位点上如果两个材料的基因型不同，那么这个单碱基的变化就可以叫做一个SNP，而同一条染色体上相邻的多个SNP根据某一规则(如连锁不平衡)组合在一起就构成一个单倍型。

1.2单倍型的研究有什么用

揭示人类遗传多样性：不同地理和人群间存在着丰富的遗传变异，通过研究单倍型可以了解人类遗传多样性的来源和分布，揭示不同人群之间的亲缘关系和迁徙历史。
遗传疾病研究：单倍型和遗传疾病之间存在关联。通过研究特定单倍型与某些遗传疾病的关系，可以帮助我们理解疾病的发生机制、风险评估和预防控制。
个体基因组信息推断：通过识别个体的单倍型，可以对其基因组进行推断，从而了解其可能携带的遗传变异和与健康相关的信息。这对于个性化医学、药物反应预测等具有重要的应用意义。
群体遗传结构分析：通过研究单倍型，可以揭示不同群体之间的遗传结构和演化关系。这对于了解人类进化历史、种群迁徙以及群体间的遗传交流具有重要意义。
等等。

这里附上看过的，感觉好懂一些的，文献，

单倍型分析技术研究进展 (ijournals.cn)

geneHapR：用于基因单倍型统计和可视化的 R 软件包 |BMC 生物信息学 |全文 (biomedcentral.com)

不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析 - 中国知网 (cnki.net)

中国人群白介素1受体相关激酶4基因多态性与脓毒症易感性的相关性研究 - 中国知网 (cnki.net)

浙江沿岸髭缟虾虎鱼的系统地理分析 - 中国知网 (cnki.net)

Evolutionary analysis and lineage designation of SARS-CoV-2 genomes - ScienceDirect

其他大差不差，看几个典型的就行。