GitHub 热榜:中国博士开发可交互全球疫情地图,登上柳叶刀!

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转自量子位,作者郭一璞

一个多月前,当你被困在家里无法出门的时候,可能每天早上第一件事就是看看疫情地图,看看昨天又新增确诊了多少。

现在,中国的疫情逐渐褪去,海外不少国家却进入了水深火热的状态。

在约翰霍普金斯大学,两位中国博士生和他们的导师一起,开发了一个可视化、可交互的全球疫情地图。这个项目已经发在了《柳叶刀》上,目前在 GitHub 开源,获得了超过 4500 颗星,也登上了 GitHub 热榜。

可视化地图

整个可视化项目的界面是这样的:

图中的数据来自世卫组织,还有包括中国 CDC、美国 CDC、欧洲 CDC 在内的各个国家和地区的疾病控制部门,通过半自动的方式更新,而且,更新的比世卫组织还快:

目前全球已经有超过 11 万人感染。

中间的地图部分可以随意调整,也能直接切换选到不同的区域:

大小不同的圆形表示该地确诊人数多少:

还可以选择不同的底图,符合不同用户的看图习惯,获取更丰富的信息:

比如切换成地形图,你就会发现美国本土的疫情分布也和地理环境有关:

你也可以分别查看整体病例数和排除治愈 / 病亡者的现有病例数地图。

整体病例:

现有病例:

湖北的圈圈小了很多。

看到这里你会注意到,只有中国、美国、加拿大、澳大利亚的统计单位到了省 / 州一层,其他国家都是以国为单位统计的。

除了地图,这个项目也可以看各国家和地区严重程度排行榜:

目前最严重的,除了中国大陆,还有韩国、意大利、伊朗、法国、德国等国家。

还有病亡人数、治愈人数的数据:

另外还有全球疫情增长图:

可以看到自从湖北全面大排查后,中国大陆的患者数量基本上不太增长,而世界上的其他地方疫情扩散的速度依然不乐观。

以上的每一个模块都是可以展开的,查看起来非常清晰。另外,研究团队也准备了移动版。

JHU 中国博士生出品

这个项目来自约翰霍普金斯大学(JHU)系统科学与工程中心(CSSE),隶属于 JHU 的土木工程系。

项目的作者有三位,是两位中国博士生和他们的导师。

一作董恩生,此前本科和硕士都是在爱达荷大学就读的,目前研究网络建模、空间可视化和传染病。除了新冠肺炎,他还研究过美国和太平洋地区的麻疹和斯里兰卡的登革热。

二作 Hongru Du,本硕分别就读于爱丁堡大学和威斯康星大学麦迪逊分校。

导师 Lauren Gardner,约翰霍普金斯大学土木工程系副教授,领导生物安全流动性跨学科研究 —— 就是传染病。另外她也曾在新南威尔士大学土木与环境工程学院任教,目前也是约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院传染病动态组成员,以及澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)的客座科学家。

传送门

GitHub:
https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19

全球疫情地图
https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

柳叶刀论文
An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in real time

作者:Ensheng Dong, Hongru Du, Lauren Gardner

https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30120-1/fulltext

约翰霍普金斯 2019-nCoV 模型博客
https://systems.jhu.edu/research/public-health/ncov-model/

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http://www.chinasem.cn/article/532152

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