探讨m6调控因子与人类癌症之间的因果关系，纯生信也能轻松上5+

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今天给同学们分享一篇生信文章“m6A Regulators Is Differently Expressed and Correlated With Immune Response of Esophageal Cancer”，这篇文章发表在Front Cell Dev Biol期刊上，影响因子为5.5。

结果解读：

m6A调控因子在基因组中的异常与人类癌症的预后相关

为了评估m6A调控因子在人类癌症中的功能重要性，作者使用cBioPortal数据库分析了m6A调控因子异常与人类癌症患者生存时间之间的相关性。如图1所示，作者观察到基因组中m6A调控因子的异常与乳腺癌、肾癌和子宫内膜癌患者的预后明显相关，然而与膀胱癌和结肠癌患者的较长生存时间明显相关。此外，在其他类型的人类癌症中，作者并未发现m6A调控因子基因组异常与生存时间之间存在显著相关性。

在宫颈癌中，m6A调控因子的扩增、删除和突变

m6A调控因子在乳腺癌和肾癌中的作用在先前的研究中已经有所暗示。本研究重点探讨m6A调控因子在子宫内膜癌中的作用。作者利用cBioPortal数据库检测了1,680例病例中m6A调控因子的遗传变异情况（图2）。作者发现23个m6A调控因子中存在不同程度的遗传变化，包括ALKBH5、FTO、HAKAI、HNRNPA2B1、HNRNPC、IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、KIAA1429、METTL14、METTL16、METTL3、RBM15、RBM15B、VIRMA、WTAP、YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、ZC3H13和ZCCHC4。如图2所示，作者揭示了大多数m6A调控因子在子宫内膜癌中存在扩增、缺失和突变的情况，其中IGF2BP2的发生率最高（11%）。

m6A调控因子在EC中的表达谱

TCGA中的m6A调控因子水平显示在图3中。其中，17个m6A调控因子在EC样本中表达增加，包括IGF2BP3（图3A），HAKAI（图3B），KIAA1429（图3C），RBM15（图3D），METTL16（图3E），YTHDF2（图3F），YTHDF1（图3G），IGF2BP2（图3H），ZC3H13（图3I），FTO（图3J），YTHDF3（图3K），RBM15B（图3L），ALKBH5（图3M），HNRNPC（图3N），HNRNPA2B1（图3O），WTAP（图3P），METTL14（图3Q）。与此同时，METTL3（图3R）和YTHDC2（图3S）在肿瘤样本中被抑制。然而，作者发现YTHDC1（图3T），ZCCHC4（图3U），IGF2BP1（图3V）在正常和肿瘤样本之间的表达没有差异。

m6A调控因子的失调与EC患者较短的OS时间相关

然后，作者使用Kaplan-Meier图来检测m6A调控因子在子宫内膜癌中的预后价值。作者发现HNRNPC（图4A）、YTHDC2（图4B）、WTAP（图4C）、VIRMA（图4D）、IGF2BP3（图4E）和HNRNPA2B1（图4F）的水平与子宫内膜癌的不良预后显著相关，表明这些m6A调控因子在子宫内膜癌中起着关键作用。

m6A调控因子的失调与EC的晚期临床分期相关

作者接下来在EC中确认了m6A调控因子与临床参数之间的相关性。如图4所示，结果显示6个m6A调控因子（HNRNPC、YTHDC2、WTAP、VIRMA、IGF2BP3和HNRNPA2B1）在食管鳞状细胞癌和食管腺癌中均上调，与正常样本相比。在这些基因中，IGF2BP3在EC样本中的上调幅度最显著（图5E）。此外，作者发现只有WTAP（图5A）和HNRNPC（图5B）在鳞状细胞癌中上调，而在腺癌中没有上调。

总结

总之，作者的研究通过生物信息学分析证实了肿瘤相关m6A调节因子的失调，这与EC患者的预后有关，因此它可以作为预后的生物标志物。此外，作者发现m6A调节因子的表达与EC中免疫浸润水平和免疫调节因子的表现相关。作者的研究表明，m6A调节蛋白可能是EC中的假定药物靶点。

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