Tombo安装和使用教程

2023-10-25 05:41

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本文主要是介绍Tombo安装和使用教程，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！

0. 引言

Tombo是nanopore开发的从三代测序数据中检测DNA modification (DNAmod: Home) 的工具。其他工具还有nanoraw，nanomod，deepmod，signalalign等。由于tombo的安装对依赖包版本的要求比较严格，所以写下本人终于成功的辛酸泪水，供大家避坑。

参考文献：DNA methylation-calling tools for Oxford Nanopore sequencing: a survey and human epigenome-wide evaluation | Genome Biology | Full Text

1. 创建新的conda环境

conda create -n tombo python=3.7conda act

这篇关于Tombo安装和使用教程的文章就介绍到这儿，希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助！

http://www.chinasem.cn/article/280390。 23002807@qq.com

Spring Security 从入门到进阶系列教程

Spring Security 入门系列《保护 Web 应用的安全》《Spring-Security-入门（一）：登录与退出》《Spring-Security-入门（二）：基于数据库验证》《Spring-Security-入门（三）：密码加密》《Spring-Security-入门（四）：自定义-Filter》《Spring-Security-入门（五）：在 Sprin

Zookeeper安装和配置说明

一、Zookeeper的搭建方式 Zookeeper安装方式有三种，单机模式和集群模式以及伪集群模式。 ■ 单机模式：Zookeeper只运行在一台服务器上，适合测试环境； ■ 伪集群模式：就是在一台物理机上运行多个Zookeeper 实例； ■ 集群模式：Zookeeper运行于一个集群上，适合生产环境，这个计算机集群被称为一个“集合体”（ensemble） Zookeeper通过复制来实现

CentOS7安装配置mysql5.7 tar免安装版

一、CentOS7.4系统自带mariadb # 查看系统自带的Mariadb[root@localhost~]# rpm -qa|grep mariadbmariadb-libs-5.5.44-2.el7.centos.x86_64# 卸载系统自带的Mariadb[root@localhost ~]# rpm -e --nodeps mariadb-libs-5.5.44-2.el7

Centos7安装Mongodb4

1、下载源码包 curl -O https://fastdl.mongodb.org/linux/mongodb-linux-x86_64-rhel70-4.2.1.tgz 2、解压放到 /usr/local/ 目录下 tar -zxvf mongodb-linux-x86_64-rhel70-4.2.1.tgzmv mongodb-linux-x86_64-rhel70-4.2.1/

中文分词jieba库的使用与实景应用（一）

知识星球：https://articles.zsxq.com/id_fxvgc803qmr2.html 目录一.定义：精确模式（默认模式）：全模式：搜索引擎模式： paddle 模式（基于深度学习的分词模式）：二自定义词典三.文本解析调整词出现的频率四. 关键词提取 A. 基于TF-IDF算法的关键词提取 B. 基于TextRank算法的关键词提取

使用SecondaryNameNode恢复NameNode的数据

1）需求： NameNode进程挂了并且存储的数据也丢失了，如何恢复NameNode 此种方式恢复的数据可能存在小部分数据的丢失。 2）故障模拟（1）kill -9 NameNode进程 [lytfly@hadoop102 current]$ kill -9 19886 （2）删除NameNode存储的数据（/opt/module/hadoop-3.1.4/data/tmp/dfs/na

Hadoop数据压缩使用介绍

一、压缩原则（1）运算密集型的Job，少用压缩（2）IO密集型的Job，多用压缩二、压缩算法比较三、压缩位置选择四、压缩参数配置 1）为了支持多种压缩/解压缩算法，Hadoop引入了编码/解码器 2）要在Hadoop中启用压缩，可以配置如下参数

Makefile简明使用教程

文章目录规则makefile文件的基本语法：加在命令前的特殊符号：.PHONY伪目标: Makefilev1 直观写法v2 加上中间过程v3 伪目标v4 变量 make 选项-f-n-C Make 是一种流行的构建工具，常用于将源代码转换成可执行文件或者其他形式的输出文件(如库文件、文档等)。Make 可以自动化地执行编译、链接等一系列操作。规则 makefile文件

使用opencv优化图片（画面变清晰）

文章目录需求影响照片清晰度的因素实现降噪测试代码锐化空间锐化Unsharp Masking频率域锐化对比测试对比度增强常用算法对比测试需求对图像进行优化，使其看起来更清晰，同时保持尺寸不变，通常涉及到图像处理技术如锐化、降噪、对比度增强等影响照片清晰度的因素影响照片清晰度的因素有很多，主要可以从以下几个方面来分析 1. 拍摄设备相机传感器：相机传

Centos7安装JDK1.8保姆版

工欲善其事，必先利其器。这句话同样适用于学习Java编程。在开始Java的学习旅程之前，我们必须首先配置好适合的开发环境。通过事先准备好这些工具和配置，我们可以避免在学习过程中遇到因环境问题导致的代码异常或错误。一个稳定、高效的开发环境能够让我们更加专注于代码的学习和编写，提升学习效率，减少不必要的困扰和挫折感。因此，在学习Java之初，投入一些时间和精力来配置好开发环境是非常值得的。这将为我

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