【TCGA】命名方式

2024-09-06 15:04

文章标签 方式命名 tcga

本文主要是介绍【TCGA】命名方式，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！

以下是TCGA-LUAD数据集中Diagnostic类型的一张WSI名称：
在这里插入图片描述

· TCGA： Project，项目名称

· 44： Tissue Source Site，样本机构来源

· 7662： Participant，项目参与者
因此，TCGA-44-7662就是这张WSI的病人编号

· 01： Sample，样本组织来源类型
肿瘤类型为01-09，正常类型为10-19，对照组为20-29

· Z： Vial，把样原始本分成了若干份，每份也都有编号。取A到Z

· 00： Portion，用于具体的测序。取01-99

参考：

https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables

这篇关于【TCGA】命名方式的文章就介绍到这儿，希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助！

http://www.chinasem.cn/article/1142338。 23002807@qq.com

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【TCGA】命名方式

参考：

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