【TCGA】命名方式

2024-09-06 15:04
文章标签 方式 命名 tcga

本文主要是介绍【TCGA】命名方式,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

以下是TCGA-LUAD数据集中Diagnostic类型的一张WSI名称:
在这里插入图片描述

· TCGA: Project,项目名称

· 44: Tissue Source Site,样本机构来源

· 7662: Participant,项目参与者
因此,TCGA-44-7662就是这张WSI的病人编号

· 01: Sample,样本组织来源类型
肿瘤类型为01-09,正常类型为10-19,对照组为20-29

· Z: Vial,把样原始本分成了若干份,每份也都有编号。取A到Z

· 00: Portion,用于具体的测序。取01-99

参考:

https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables

这篇关于【TCGA】命名方式的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1142338

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