RCS plot 包内置数据集使用时报错,如何解决?

2024-08-29 16:36

本文主要是介绍RCS plot 包内置数据集使用时报错,如何解决?,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

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问题描述

  RCS plot 包内置数据集使用时报错,如何解决?RCS plot 包内置数据集使用时报错

> # 加载包
> library(tibble)
> library(dplyr)
> library(survival)
> library(plotRCS)
> head(cancer)id age    sex  race size metastasis   status time
1 10274  53   Male White   27         No Censored   12
2 56998  32   Male Black  185         No     Dead    5
3 60010  69   Male White   51         No     Dead   13
4 24307  61   Male White   37         No Censored   50
5  5253  53 Female White   25         No Censored   27
6 39685  56   Male Other   38         No Censored   17
> summary(cancer)id                 age            sex         race          size        metastasis      status   Length:903         Min.   :20.00   Female:211   White:621   Min.   :  4.00   No :790    Censored:321  Class :character   1st Qu.:57.00   Male  :692   Black:143   1st Qu.: 29.00   Yes:113    Dead    :582  Mode  :character   Median :63.00                Other:139   Median : 45.00                            Mean   :62.57                            Mean   : 59.03                            3rd Qu.:70.00                            3rd Qu.: 78.00                            Max.   :80.00                            Max.   :240.00                            time      Min.   : 0.00  1st Qu.: 4.00  Median :15.00  Mean   :21.22  3rd Qu.:32.00  Max.   :83.00  
> # 执行分析
> rcsplot(data = cancer,
+         outcome = "status",
+         time = "time",
+         exposure = "age",
+         covariates = c("sex", "race"))
Error in reformulate(attr(termobj, "term.labels")[-dropx], response = if (keep.response) termobj[[2L]],  : 'termlabels'必需是长度至少为一的字节矢量

友情提示:
  如上问题有的来自我自身项目开发,有的收集网站,有的来自读者…如有侵权,立马删除。再者,针对此专栏中部分问题及其问题的解答思路或步骤等,存在少部分搜集于全网社区及人工智能问答等渠道,若最后实在是没能帮助到你,还望见谅!并非所有的解答都能解决每个人的问题,在此希望屏幕前的你能够给予宝贵的理解,而不是立刻指责或者抱怨!如果你有更优解,那建议你出教程写方案,一同学习!共同进步。

解决方案

  如下是上述问题的解决方案,仅供参考:

  报错信息 Error in reformulate(attr(termobj, "term.labels")[-dropx], response = if (keep.response) termobj[[2L]], : 'termlabels' must be a byte vector of length at least one 指出在 reformulate 函数中 termlabels 必须是长度至少为一的字节向量,但当前不是。

  这个问题通常发生在模型公式的构建过程中,可能是因为传递给函数的参数格式不正确或者某些变量名不存在。

解决步骤:

  1. 检查数据集:确保数据集 cancer 中的列名和传递给 rcsplot 函数的参数名称一致。

  2. 检查参数名称:确保 outcometimeexposurecovariates 的值在数据集中确实存在。

  3. 检查数据类型:确保传递给函数的变量是正确的数据类型,特别是 outcome 应该是一个因子类型。

  4. 使用 reformulate 函数:如果需要手动构建模型公式,确保使用 reformulate 函数正确。

代码示例:

# 加载必要的包
library(tibble)
library(dplyr)
library(survival)
library(plotRCS)# 查看数据集
head(cancer)# 确保 status 是因子类型
cancer$status <- as.factor(cancer$status)# 确保 age 是数值类型
cancer$age <- as.numeric(cancer$age)# 确保 time 是数值类型
cancer$time <- as.numeric(cancer$time)# 重新执行分析
rcsplot(data = cancer,outcome = "status",time = "time",exposure = "age",covariates = c("sex", "race"))

额外的检查:

  • 检查数据集的完整性:确保没有缺失值或异常值。
  • 检查变量名的大小写:R 是大小写敏感的,确保变量名的大小写一致。

  如果上述步骤仍然不能解决问题,可能需要更详细的错误信息或数据集的更多细节来进行进一步的诊断。

  希望如上措施及解决方案能够帮到有需要的你。

  PS:如若遇到采纳如下方案还是未解决的同学,希望不要抱怨&&急躁,毕竟影响因素众多,我写出来也是希望能够尽最大努力帮助到同类似问题的小伙伴,即把你未解决或者产生新Bug黏贴在评论区,我们大家一起来努力,一起帮你看看,可以不咯。

  若有对当前Bug有与如下提供的方法不一致,有个不情之请,希望你能把你的新思路或新方法分享到评论区,一起学习,目的就是帮助更多所需要的同学,正所谓「赠人玫瑰,手留余香」。

☀️写在最后

  ok,以上就是我这期的Bug修复内容啦,如果还想查找更多解决方案,你可以看看我专门收集Bug及提供解决方案的专栏《CSDN问答解惑-专业版》,都是实战中碰到的Bug,希望对你有所帮助。到此,咱们下期拜拜。

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