生物信息学数据分析服务

2024-08-24 19:28

本文主要是介绍生物信息学数据分析服务,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

常见个性化分析列表

GEO相关服务
1,芯片数据挖掘。根据芯片类型,计算表达谱,差异基因等
2,高通量测序数据挖掘。根据测序类型,计算表达谱,差异或者peak calling等
3,多组学数据联合分析
4,GEO原始数据上传/下载

TCGA相关服务
1,特定癌症的表达谱,差异分析
2,Cox回归,生存分析
3,预后模型
4,免疫浸润

转录组相关
1,GSEA/GSVA分析
2,CNC共表达网络分析
3,ceRNA网络分析,包括LncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络等
4,WGCNA分析
5,GO,Pathway分析,常规物种和特殊物种
6,蛋白质-蛋白质相互作用分析
7,hub基因分析
8,circRNA同源分析
9,时序表达分析
10,Venn图
11,PCA分析
小RNA相关
1,miRNA靶基因预测
2,miRNA-靶基因网络分析
3,miRNA二级结构分析
4,piRNA靶基因预测
测序服务:miRNA-seq

ChIP、MeDIP相关
1,峰可视化
2,motif分析
3,circos图

MeRIP/m6A相关
1,m6A和RNA-seq联合分析四象限图
2,相关系数
3,peak venn图
4,circos图
5,motif分析
6,metaplot

eccDNA相关
1,eccDNA长度分布
2,motif分析
3,染色体分布
4,不同基因组特征分布

其他联合分析
1,RNA-seq和MeRIP-seq联合分析
2,miRNA-seq和circRNA-seq联合分析
3,mRNA-seq和eccDNA-seq联合分析

个性化作图、分析相关
1,提供论文例图定制开发
2,提供数据,测试程序等

这篇关于生物信息学数据分析服务的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1103390

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