「Debug R」有一种报错叫做Windows专享

2024-06-23 20:32

本文主要是介绍「Debug R」有一种报错叫做Windows专享,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

今天在R里面用Rsamtools 读取BAM文件时遇到了下面的报错

[W::bam_hdr_read] bgzf_check_EOF: No error
[E::bgzf_read] Read block operation failed with error -1 after 55 of 167 bytes

这个错误在网上搜了很久,发现很多人都遇到了,但是在这些人的提问后面都没有给出确切的解决方案。

后来我想到会不会是因为Windows上的HTSLIB太老了,于是我拿我的Ubuntu系统上的R测试了一下,一切都非常顺利。

所以如果你也遇到了这个问题,我建议就是那就是用Linux上的R,毕竟Windows版本的R用到的HTSLIB已经非常古老了,所以里面可能存在一些bug。而在Linux里面,因为要从头编译,所以可以用新版的HTSLIB,所以不会出现错误。

如果你只有一台Windows10系统,不希望装双系统和虚拟机的话,推荐跟着我bilibili的视频在Windows10上配置一个WSL,然后安装R语言即可。

「转录组入门生信」在Windows10上配置一个Linux

2013053-1108e8a0998e8c4b.png
视频课

这篇关于「Debug R」有一种报错叫做Windows专享的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1088203

相关文章

SpringBoot启动报错的11个高频问题排查与解决终极指南

《SpringBoot启动报错的11个高频问题排查与解决终极指南》这篇文章主要为大家详细介绍了SpringBoot启动报错的11个高频问题的排查与解决,文中的示例代码讲解详细,感兴趣的小伙伴可以了解一... 目录1. 依赖冲突:NoSuchMethodError 的终极解法2. Bean注入失败:No qu

springboot报错Invalid bound statement (not found)的解决

《springboot报错Invalidboundstatement(notfound)的解决》本文主要介绍了springboot报错Invalidboundstatement(not... 目录一. 问题描述二.解决问题三. 添加配置项 四.其他的解决方案4.1 Mapper 接口与 XML 文件不匹配

java常见报错及解决方案总结

《java常见报错及解决方案总结》:本文主要介绍Java编程中常见错误类型及示例,包括语法错误、空指针异常、数组下标越界、类型转换异常、文件未找到异常、除以零异常、非法线程操作异常、方法未定义异常... 目录1. 语法错误 (Syntax Errors)示例 1:解决方案:2. 空指针异常 (NullPoi

SpringBoot项目启动报错"找不到或无法加载主类"的解决方法

《SpringBoot项目启动报错找不到或无法加载主类的解决方法》在使用IntelliJIDEA开发基于SpringBoot框架的Java程序时,可能会出现找不到或无法加载主类com.example.... 目录一、问题描述二、排查过程三、解决方案一、问题描述在使用 IntelliJ IDEA 开发基于

Windows Server服务器上配置FileZilla后,FTP连接不上?

《WindowsServer服务器上配置FileZilla后,FTP连接不上?》WindowsServer服务器上配置FileZilla后,FTP连接错误和操作超时的问题,应该如何解决?首先,通过... 目录在Windohttp://www.chinasem.cnws防火墙开启的情况下,遇到的错误如下:无法与

关于Docker Desktop的WSL报错问题解决办法

《关于DockerDesktop的WSL报错问题解决办法》:本文主要介绍关于DockerDesktop的WSL报错问题解决办法的相关资料,排查发现是因清理%temp%文件夹误删关键WSL文件,... 目录发现问题排查过程:解决方法其实很简单:重装之后再看就能够查到了:最后分享几个排查这类问题的小www.cp

Python解析器安装指南分享(Mac/Windows/Linux)

《Python解析器安装指南分享(Mac/Windows/Linux)》:本文主要介绍Python解析器安装指南(Mac/Windows/Linux),具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助,如有... 目NMNkN录1js. 安装包下载1.1 python 下载官网2.核心安装方式3. MACOS 系统安

Pycharm安装报错:Cannot detect a launch configuration解决办法

《Pycharm安装报错:Cannotdetectalaunchconfiguration解决办法》本文主要介绍了Pycharm安装报错:Cannotdetectalaunchconfigur... 本文主要介绍了Pycharm安装报错:Cannot detect a launch configuratio

Windows系统下如何查找JDK的安装路径

《Windows系统下如何查找JDK的安装路径》:本文主要介绍Windows系统下如何查找JDK的安装路径,文中介绍了三种方法,分别是通过命令行检查、使用verbose选项查找jre目录、以及查看... 目录一、确认是否安装了JDK二、查找路径三、另外一种方式如果很久之前安装了JDK,或者在别人的电脑上,想

Windows命令之tasklist命令用法详解(Windows查看进程)

《Windows命令之tasklist命令用法详解(Windows查看进程)》tasklist命令显示本地计算机或远程计算机上当前正在运行的进程列表,命令结合筛选器一起使用,可以按照我们的需求进行过滤... 目录命令帮助1、基本使用2、执行原理2.1、tasklist命令无法使用3、筛选器3.1、根据PID