「Debug R」有一种报错叫做Windows专享

2024-06-23 20:32

本文主要是介绍「Debug R」有一种报错叫做Windows专享,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

今天在R里面用Rsamtools 读取BAM文件时遇到了下面的报错

[W::bam_hdr_read] bgzf_check_EOF: No error
[E::bgzf_read] Read block operation failed with error -1 after 55 of 167 bytes

这个错误在网上搜了很久,发现很多人都遇到了,但是在这些人的提问后面都没有给出确切的解决方案。

后来我想到会不会是因为Windows上的HTSLIB太老了,于是我拿我的Ubuntu系统上的R测试了一下,一切都非常顺利。

所以如果你也遇到了这个问题,我建议就是那就是用Linux上的R,毕竟Windows版本的R用到的HTSLIB已经非常古老了,所以里面可能存在一些bug。而在Linux里面,因为要从头编译,所以可以用新版的HTSLIB,所以不会出现错误。

如果你只有一台Windows10系统,不希望装双系统和虚拟机的话,推荐跟着我bilibili的视频在Windows10上配置一个WSL,然后安装R语言即可。

「转录组入门生信」在Windows10上配置一个Linux

2013053-1108e8a0998e8c4b.png
视频课

这篇关于「Debug R」有一种报错叫做Windows专享的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助!



http://www.chinasem.cn/article/1088203

相关文章

IDEA编译报错“java: 常量字符串过长”的原因及解决方法

《IDEA编译报错“java:常量字符串过长”的原因及解决方法》今天在开发过程中,由于尝试将一个文件的Base64字符串设置为常量,结果导致IDEA编译的时候出现了如下报错java:常量字符串过长,... 目录一、问题描述二、问题原因2.1 理论角度2.2 源码角度三、解决方案解决方案①:StringBui

Python Jupyter Notebook导包报错问题及解决

《PythonJupyterNotebook导包报错问题及解决》在conda环境中安装包后,JupyterNotebook导入时出现ImportError,可能是由于包版本不对应或版本太高,解决方... 目录问题解决方法重新安装Jupyter NoteBook 更改Kernel总结问题在conda上安装了

Goland debug失效详细解决步骤(合集)

《Golanddebug失效详细解决步骤(合集)》今天用Goland开发时,打断点,以debug方式运行,发现程序并没有断住,程序跳过了断点,直接运行结束,网上搜寻了大量文章,最后得以解决,特此在这... 目录Bug:Goland debug失效详细解决步骤【合集】情况一:Go或Goland架构不对情况二:

Python安装时常见报错以及解决方案

《Python安装时常见报错以及解决方案》:本文主要介绍在安装Python、配置环境变量、使用pip以及运行Python脚本时常见的错误及其解决方案,文中介绍的非常详细,需要的朋友可以参考下... 目录一、安装 python 时常见报错及解决方案(一)安装包下载失败(二)权限不足二、配置环境变量时常见报错及

Windows设置nginx启动端口的方法

《Windows设置nginx启动端口的方法》在服务器配置与开发过程中,nginx作为一款高效的HTTP和反向代理服务器,被广泛应用,而在Windows系统中,合理设置nginx的启动端口,是确保其正... 目录一、为什么要设置 nginx 启动端口二、设置步骤三、常见问题及解决一、为什么要设置 nginx

MySQL报错sql_mode=only_full_group_by的问题解决

《MySQL报错sql_mode=only_full_group_by的问题解决》本文主要介绍了MySQL报错sql_mode=only_full_group_by的问题解决,文中通过示例代码介绍的非... 目录报错信息DataGrip 报错还原Navicat 报错还原报错原因解决方案查看当前 sql mo

在 Windows 上安装 DeepSeek 的完整指南(最新推荐)

《在Windows上安装DeepSeek的完整指南(最新推荐)》在Windows上安装DeepSeek的完整指南,包括下载和安装Ollama、下载DeepSeekRXNUMX模型、运行Deep... 目录在www.chinasem.cn Windows 上安装 DeepSeek 的完整指南步骤 1:下载并安装

解决IDEA使用springBoot创建项目,lombok标注实体类后编译无报错,但是运行时报错问题

《解决IDEA使用springBoot创建项目,lombok标注实体类后编译无报错,但是运行时报错问题》文章详细描述了在使用lombok的@Data注解标注实体类时遇到编译无误但运行时报错的问题,分析... 目录问题分析问题解决方案步骤一步骤二步骤三总结问题使用lombok注解@Data标注实体类,编译时

linux报错INFO:task xxxxxx:634 blocked for more than 120 seconds.三种解决方式

《linux报错INFO:taskxxxxxx:634blockedformorethan120seconds.三种解决方式》文章描述了一个Linux最小系统运行时出现的“hung_ta... 目录1.问题描述2.解决办法2.1 缩小文件系统缓存大小2.2 修改系统IO调度策略2.3 取消120秒时间限制3

解决systemctl reload nginx重启Nginx服务报错:Job for nginx.service invalid问题

《解决systemctlreloadnginx重启Nginx服务报错:Jobfornginx.serviceinvalid问题》文章描述了通过`systemctlstatusnginx.se... 目录systemctl reload nginx重启Nginx服务报错:Job for nginx.javas