本文主要是介绍FreeSurFer的recon-all处理流——学习记录，希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值，需要的开发者们随着小编来一起学习吧！
官方网址：ReconAllTableStableV6.0 - Free Surfer Wiki
（1）颅骨剥离skullstrip
颅骨剥离后生成文件：/mri/brainmask.mgz
（2）图像配准canorm
Freesurfer图像配准：将 mri/nu.mgz 体积与 FREESURFER_HOME/average 中的默认 GCA 图集对齐；
图像配准后生成文件：/mri/norm.mgz
（3）图像校正normalization2
Freesurfer图像校正：强度标准化（Intensity Normalization）
图像校正后生成文件：/mri/brain.mgz
（4）图像分割segmentation
Freesurfer图像分割：使用强度、邻域和平滑度约束进行白质分割（White Matter Segmentation）。输入为 mri/brain.mgz，输出为 mri/wm.mgz。
图像分割后生成文件：/mri/wm.mgz
这篇关于FreeSurFer的recon-all处理流——学习记录的文章就介绍到这儿，希望我们推荐的文章对编程师们有所帮助！
