16srna专题

生物信息学Bioinformatics学习笔记(四)- Data analysis-16sRNA

Data analysis-16sRNA 常用V3V4区域进行扩增子测序 Basic analytical procedure 1.原始数据处理 ·去除接头序列,并将双端测序序列拼接成单条序列。 ·根据测序barcode序列区分不同的样本序列。 ·过滤低质量序列和无法比对到16s rDNA数据库的序列。 2.OTU(可执行操作单元)分类和统计 ·以97%的序列相似度将所有序列进行同