转座子专题

转座子的鉴定

1.鉴定 将转座子鉴别和注释的方法分为3大类: ①从头算法; ②基于同源性的方法 ; ③联合算法。 其中,从头算法又包括基于基因组序列比对的方法、K—mer方法和基于结构特征的方法 ; 基于同源性的方法包括基于同源序列比对的方法和基于隐马尔柯夫模型(HMM)的方法。 不同的算法实现的目标有所不同,如从头算法主要是为了发现新的转座子 ,因此常用来在新测序的基因组中鉴别新的转座子 ,而多

转座子的类型与转座机制

一般来说,按照转座方式的不同,可将转座子分为三大类:I型转座子(Class I elements),II型转座子(Class II elements)以及Helitron转座子。   三种转座子的转座机制【1】I型转座子又叫反转座子(retrotransposon)。在植物基因组中,反转座子是最常见的转座原件家族,它们占据了许多植物基因组的大部分。根据反转座子的转座机制,人们形象地称其

转座子的简介

1. 转座子的概述 芭芭拉·麦克林托克(Barbara McClintock,1902年6月16日-1992年9月2日),美国著名女性细胞遗传学家,她首次发现并重点研究了玉米转座子 一个转座子由基因组的一个位置移动到另一个位置的过程称为转座。促进转座的酶称转座酶。转座子常常编码它自己的转座酶,并且每次移动时携带转座必需的基因一起在基因组内跃迁。 1.1 转座作用具有什么遗传学效应呢? (1

转座子的鉴定

1.鉴定 将转座子鉴别和注释的方法分为3大类: ①从头算法; ②基于同源性的方法 ; ③联合算法。 其中,从头算法又包括基于基因组序列比对的方法、K—mer方法和基于结构特征的方法 ; 基于同源性的方法包括基于同源序列比对的方法和基于隐马尔柯夫模型(HMM)的方法。 不同的算法实现的目标有所不同,如从头算法主要是为了发现新的转座子 ,因此常用来在新测序的基因组中鉴别新的转座子 ,而多

转座子注释

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