病毒组专题

Nature综述:梁冠翔等总结近20年人类病毒组学的发展

https://doi.org/10.1038/s41579-021-00536-5 2021年3月30日,美国宾夕法尼亚大学博士后梁冠翔和Frederic Bushman教授作为共同通讯作者在Nature Reviews Microbiology在线发表了题为The human virome: assembly, composition and host interactions的综述论文

宏基因组学中基于Kraken2、Blast、ViPhOG和VirSorter等工具分析病毒组的详细流程,包括数据预处理、病毒序列检测、分类和功能注释等步骤

宏基因组学中分析病毒组的详细流程,包括数据预处理、病毒序列检测、分类和功能注释等步骤。 示例代码使用了常用的生物信息学工具,如Kraken2、Blast、ViPhOG和VirSorter等。 1. 数据预处理 质量控制: 使用FastQC进行原始测序数据的质量检查,然后使用Trimmomatic或Cutadapt去除低质量 reads 和接头。 步骤: 使用FastQC进行质量