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「JCVI教程」如何基于物种的CDS的blast结果绘制点图(dotplot)
这是唐海宝老师GitHub上的JCVI工具的非官方说明书。 该工具集的功能非常多,但是教程资料目前看起来并不多,因此为了能让更多人用上那么好用的工具,我就一边探索,一边写教程 这一篇文章教大家如何利用JCVI里面的工具绘制点图,展现两个物种之间的共线性关系。 在分析之前,你需要从PhytozomeV11 下载A.thaliana和Alyrata的CDS序列,保证文件夹里有如下内容 Al
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Plot 绘制点图
可视化能帮助我们更好的理解高维空间到底发生了什么。 一般可以使用matlba的pyplot来进行绘制: import matplotlib.pyplot as plt scatter 对二维空间点进行绘制,最简单的如下: """Simple demo of a scatter plot."""import numpy as npimport matplotlib.pyplot a
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R语言作图——Violin plot with dot (小提琴图+点图)
原创:黄小仙 小提琴图之前已经画过了,不过最近小仙又看到一种貌美的画法,决定复刻一下。 文献中看到的图如下: Step1. 绘图数据的准备 首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式。 作图数据如下: Step2. 绘图数据的读取 data<-read.csv(“your file path”, header = T)#注释:head
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Qt/C++编写地图综合应用1-闪烁点图
一、前言 Qt作为一个超大型的一站式GUI超市开发集成环境,不仅集成了大量的可视化UI组件,还提供了网络库、数据库操作、文件操作等类库,封装的还是相当精彩一步到位,根据个人身边的一些程序员朋友了解,自从用了Qt以来发现越来越喜欢用Qt本身的类来处理,除非一些要求很高的应用场景比如并发网络才需要去使用第三方库,不然就是直接使用Qt封装好的类,用起来非常爽,尤其是类的名称和方法的名称,几乎很自然的就
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MATLAB-最简单基础的画二维图(点图、折线图、拟合曲线)
之前写过一篇关于画matlab折线图的博客,但是写的非常潦草。也算是为了以后自己方便看,打算重新把画二维图部分再写一下,因此有了这篇博客。 画二维图形主要使用plot函数,使用方法说明:(官网) 1. 画一组二维图 (1)散点 clear all;clcx=[1,2,3];y=[4,5,6];plot(x,y,'r*'); %以x矩阵的值为横坐标,y矩阵值为纵坐标,
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