在流式细胞分析中，人CD3通常被用作将T细胞与其他淋巴细胞区分开来的谱系特异性标记物。CD3 对T细胞的特异性与其在T细胞发育的所有阶段均可出现结合的特性，使其成为检测健康T细胞和T细胞癌（例如白血病、淋巴瘤）的理想标志物。 单克隆CD3抗体可结合CD3/T细胞抗原受体复合物的ε链，经常用于流式细胞和免疫荧光应用，以识别表达CD3的免疫细胞亚群。已知表达CD3表面标志物的细胞包括约60-85