博主其实对未知的可变剪接分类有些困惑，但想了很久才使用了一项比较复杂的算法，接下来并不是分类，而是先转换数据库，因为ensembl|gencode数据库的格式并不能满足博主的需求，转换后更能方便地处理接下来的工作： #!/usr/bin/env perluse warnings;use strict;my (%gene);open GTF, $ARGV[0] or die $!;whil

想把之前做的可变剪接模型给大家说一下，看看有什么遗漏的没有，由于当时想法比较复杂，所以程序有点多，大致分三个部分来进行。 首先，拿到的结果是tophat给出的junction的数据，其次博主使用的数据库是ensembl的数据库，gencode也可以，先得到已知的参考junction： #!/usr/bin/env perluse warnings;use strict;die "perl